Wie erfolgt die Kristallisation von Proteinen?
Durch die Übersättigung einer Proteinlösung durch Salzzugabe oder Erhöhung der Proteinkonzentration
Was ist das Phasenproblem?
Bei der Röntgenstrukturbestimmung ist abgestrahltes Licht gegeneinander Phasenverschoben. Es werden Methoden zur Phasenrekonstruktion benötigt
Was ist die durschnittliche Größe eines Atoms?
1 Anström (=0,1nm)
Wie funktioniert die Proteinstrukturbestimmung durch Transmissionselektronenmikroskopie?
Proteine streuen Elektronen nur schwach, sodass ein kontrastarmes, verrauschtes Bild entsteht. Durch Einfrieren der Proteine in amorphes Eis wird die Kontrastierung verbessert.
Durch das Aufsummieren vieler Bilder wird das Signal/Rausch-Verhältnis verbessert.
Welche Formen von Interferenz gibt es?
Destruktive Interferenz: Die Wellenlängen gleichen sich aus
Konstruktive Interferenz: Die Wellenlängen addieren sich (nur bei ganzzaligen Vielfachen der Wellen)
Wie funktioniert die Röntgenstrukturbestimmung?
Ein Proteinkristall wird in eine drehbare Haltevorrichtung eingespannt und mit Röntgenstrahlung bestrahlt. Die Strahlung wird am Kristall gestreut und dann an einem Detektor aufgefangen. Durch die Drehung des Kristalls entsteht am Detektor ein Punktemuster, welches mathematisch ausgewertet wird. Das Ergebnis ist zunächst eine Elektronendichte, welche im Anschluss interpretiert werden muss.
Weshalb sind häufig Lücken in der Kristallstruktur zu finden?
Die Elektronendichte kann oft nicht klar interpretiert werden. Häufig passiert dies in Turns aufgrund der Flexibilität der Backbone
Was sind die 3 Methoden zur Proteinstrukturbestimmung?
-> Röntgenstrukturbestimmung
-> Elektronenmikroskopie
-> NMR (Nucleare Magnetische Resonanzmethode)
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