03_molekulare-Visualisierung

• all-atom line representation

• Simple topology diagrams

• cartoon diagrams

• TOPS diagrams

• Stereoview

• lineare Sequenz-Annotation der Struktur

• gesamte strukturelle Charakteristik schwer zu erkennen

Strukturierung spezieller Teile in 2D

-> Vergleich von Proteinen nach Topologie

=> (anti-) parallele beta-Faltblaetter erkennbar

vereinfachter Vergleich verschiedener Proteine moeglich

• 2D Topologie und Interaktion

• Kreis = Helices

• Dreieck = Faltblatt

• 3D impliziert

+ Proteinfaltung essenzieller beta-Faltblaettter effektiv erkennbar und unterscheidbar

+ Erkennen der verschiedenen Schichten nach der Chiralitaet der supersekundaeren Verbindung zw. parallelen beta-Faltblaettern

- keine Unterscheidung zwischen verschiedenen allen alpha-Faltungen

3D-Bild mittels spezieller Brille und Closeup moeglich