Definitionen - MSA
MSA & Evolution
DNA-Alignment
Aminosäurealignment
DNA- oder Aminosäurealignment?
MSA: Anwendungsbeispiele
Beispiel Hb:
ABER:
Wie kommt man zum MSA?
Bewertung eines MSA - Prinzip
Welche Bewerungsmethoden gibt es für ein MSA?
sum-of-pairs: für DNA und Proteine
Bewertung mithilfe eines Stammbaums (z.B. CLUSTALW)
Algorithmische Lösungsansätze
„sum of pairs-score“
Bewertung mithilfe eines Stammbaums
Nachteil exakter Verfahren:
Heuristische Verfahren
Progressives Alignment
Vorgehensweise Progressives Alignment
Praktische Hinweise für globale MSAs
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