Definiere Quorum Sensing!
Zell-Zell-Kommunikationsmechanismus, mit dem Bakterien ihre eigene Anzahl zählen, indem sie ein Signalmolekül produzieren, dass sie in ihre Umgebung exportieren und dessen Anhäufung feststellen können
Bakterien können kommunizieren
Bakterien haben eine multizelluläre Verhaltensweise
Bakterien können sich selber von anderen unterscheiden
Was war der erste Befund der darauf hingedeutet hat, dass Bakterien in der Lage sind miteinander zu kommunizieren?
Lumineszent
—> Aktivität der Luciferase ist von der Dichte der Population abhängig
Mit welchem Experiment hat Woodland Hastings die Grundlage von Quorum Sensing endeckt?
Kultur von biolumineszierenden Bakterien (Vibrio fischeri) in einem frischen Medim wachsen lassen
einmal hat man die Flüssigkultur bei einer hohen OD und einmal bei einer niedrigen OD gefiltert
die Medien die man aus den jeweiligen Filteschritten bekommen hat, wurden erneut mir Zellen beimpft
man hat die beiden Kulturen erneut wachesn lassen und die Lumineszenz gemessen
die Bakterien die in dem Medium gewachsen sind, das aus einer hohen OD entnommen wurden, wiesen deutlich höhere Lumineszenz auf als die Bakterien die in dem Medium gewachsen sind, welches von der gerinen OD entnommen wurde
—> Schuussfolgern kann man daraus, dass sich in dem verbrauchtem Medium ein Inducer befindet der die Lumineszenz induziert
Wodurch wird Quorum Sensing ausgelöst?
Quorum Sensing wird durch die Produktion, Freisetzung, Akkumulation und gruppenweite Erkennung von extrazellulären Molekülen, den sogenannten Autoinduktoren, vermittelt
Wie funktioniert die Symbiose zwischen dem Tintenfisch Euprymna scolopes und den V. fischeri Bakterien in seinem Leuchtorgan?
Nachtzyklus (Aktivierung der Lumineszenz während der Nacht)
Freisetzung von Nährstoffen aus dem Tintenfischreservoir für die Bakterien
Anstieg der Bakteriendichte im Leuchtorgan
Autoinducer werden freigesetzt und Lumineszenz findet in der Nacht statt
Tagzyklus (Deaktivierung der Lumineszenz während des Tages)
verringerte Freisetzung von Nährstoffen
Verlangsamung des Wachstums und der Vermehrung der Bakterien —> keine Lumineszenz
Ausscheidung überschüssiger Bakterien zur Regulierung der Dichte
Erkläre kurz das LuxI/LuxR-System in Vibrion fischeri!
LuxI ist die Autoinducer Synthase
produziert die Acyl-Homoserin Lactone (AHL) autoinducer
Autoinducer werden freigesetzt
LuxRi ist der Zytoplasmatische Autoinducer-Rezeptor
Autoinducer bindet an LuxR (Regulator) und akiviert LuxR-Proteine
transcriptional activator bindet an target genes die für Luciferase codiern
Aus wie vielen Genen besthet das Lux-Operon und wofür codieren LuxI und LuxR?
Lux-Operon besteht aus 7 genen
LuxI ist eine Synthase —> syntethisiert Acyl-Homoserin Lactone (Autoinducer)
AI diffunidert in das Medium und akkumuliert sich
wenn es eine gewisse Konzentration erreicht hat, diffundiert AI zurück in die Zelle und binder and as Aktivator-Protein LuxR
das führt zu einer erhöhten Transkription des Lux-Operons
Welche Reaktion katalysiert die Luciferase?
katalysiert die sauerstoffabhängige Umsetzung eines ALdehyds zu Carbonsäure wobei FMNH2 oxidiert wird und Licht entsteht
Welche LuxR-Type Quorum sensing Rezeptoren gibt es? Was haben sie gemeinsam und worin unterscheiden sie sich?
TraR —> bindet Autoinduer und DNA
QscR —> bindet Autoinducer
CviR —> bindet an Inhibitor Chloracetone
—> meistens Transkriptions-Aktivatoren
alle sind Dimere und haben eine DNA-bindende Domäne (carboxy-terminal DNA-binding) und eine Ligand-bindende Domäne (amino-terminal AHL-binding)
TraR nimmt asymmetrischen Dimer an und QscR und CviR haben fast symmetrische Architektur der Untereinheiten
Welche Funktionen können durch Quorum Sensing kontrolliert werden?
Virulenz
Biofilmbildung
Sporulationi
Motilität
Eisenchelation
Naturstoffproduktion
Welche Sturkutell unterschiedlichen Autoinduver gibt es?
Acyl-Homolaktone (AHL)
Oligopeptide
Autoinduktor-2 (AI-2)
Quinolone
Was sind die drei Klassen von Quorum Sensing Systemen in Bakterien?
LuxI/LuxR-Typ in Gram-negativen Bakterien, wo Acyl-Homoserin Lactone genutzt werden
Oligopeptide-Zwei-Komponenten-System in Gram-positiven Bakterien, wo kelien Peptide genutz werden
luxS-codierte AI-2, sowohl in Gram-positven- und negativen Bakterien
Wie funktionieren die Prallel-Quorum Sensing Systeme in Vibrio harveyi?
System 1:
besteht aus LuxM-abhängigem Autoinduktor HAI-1 und dem HAI-1-Sensor NuxN
bei geringer Zelldichte (Abwesenheit von AI) autophosphorylieren und übertragen LuxN und LuxQ Phosphat auf das Phosphotransferase-Protein LuxU und anschließend LuxO
LuxO ist in Verbindung mit Sigma-Faktor54 aktiv und aktiviert Gen-Expression für sRNA die LuxR-mRNA destabiliseren (luxR ist für Quorum Sensing notwendig)
—> keine Lumineszenz bei geringer Zelldichte
System 2:
besteht aus LuxS-abhängigen Autoinduktor AI-2 und AI-2-Detektor LuxPQ
bei hoher Zellldichte (Anwesenheit von Autoinduktoren) wechseln LuxN und LuxQ von Kinasen zu Phosphatasen
Phosphatdurchfluss im System wird umgekehrt
LuxO wird dadruch das Phosphat entszogen und somit inaktiviert und kann sRNA nicht mehr produzieren
Translation von luxR-mRNA kann stattfinden
LuxR bindet an Lux-Promotor Tranlation findet statt
—> Lumineszenz bei hoher Zelldichte
Bei P. aeruginosa sind Bakterien die Quorum-Sensing betreiben. lasI ist dabei die Synthase die den AI porduiziert. Wie würde man den Phänotyp erwarten bei einer lasI Mutante und bei einer lasI-Mutaante wo der AI hinzugegeben wurde.
lasI Mutante hat einen dünneren und mehr einheitlichen Biofilm
lasI Mutante mit Zugabe von AI ähnelt dem Wildty, da der Rezeptor vorhanden ist und der hinzugegebene Autoinducer daran binden kann und somit quorum sensing stattfinden kann
Wie funktioniert two component type quorum sensing?
Kommunikation innerhalb einer Spezies
die meisten Peptide-Quorum-Sensing-Signal werden von einen Precurser-Peptide gespalten und dann modfiziert
können nicht durch Membran diffundieren sondern benötigen Exporter
Sensor-Kinase (HK - Histidin-Kinase) erkennt Autoinduktoren
Durchläuft Autophosphorylierung bei Bindung der Autoinduktoren
Überträgt das phosphorylierte Signal auf einen Response-Regulator
Bindet an DNA und reguliert die Genexpression
Aktiviert oder reprimiert die Transkription von Zielgenen.
Koordiniertes Verhalten basierend auf Bakteriendichte
Erkläre das Grundprinzip von competeive quorm sensing am Beispiel von Sporulation and Kompetenz in Bacillus subrilis.
System für Kompetenz:
ComX als AI wird über ComQ (Effluxpumpe) nach außen transportiert
Histidin-Sensor-Kinase ComP bindet ComX
Autophosphorilierung von ComP und Phosphate-Transfer auf response regulator ComA
—> aktivierung der Kompetenz-Gene
System für Sporulation und Kompetenze
oligopeptide autoinducer CSF (competence and sporulation) wird über Opp (peptide transporter) in Zelle eingeführt
bei geringer intrazellulärer Konzentration von CSF
CSF bindet an RapC und unterbricht die Bindung von RapC an ComA
—> Kompetenz Entwicklung
bei hoher intrazellulärer Konzentration von CSF
CSF inhibiert ComP-ComA Signal Kaskade
—> Reduizieurng der Kompetnez und bevorzugte Sporulation
CSF kann Sporulation direkt fördern indem es RapB-vermittelre dephosphorilierung des response regulators Spo0F inhibiert
Was ist Dysbiosis?
Dysbiose (auch Dysbakteriose genannt) ist gekennzeichnet durch eine Störung des Mikrobioms, die zu einem Ungleichgewicht der Mikrobiota, Veränderungen ihrer funktionellen Zusammensetzung und Stoffwechselaktivitäten oder einer Verschiebung ihrer lokalen Verteilung führt.
Wodurch kann Dysbiose auseglöst werden?
z.B. durch Antibiotika
—> nicht nur die pathogenen Bakteren werden bekämpft sondern auch die nützlichen, was zu einem Ungelichgewicht der Bakteriengemeinschaft führt = Dysbiose
Wie kann man eine Dysbiose die durch Antibiotika verursacht wurde ausgleichen?
Zugabe von genetisch modifiziertem E. coli und Autoinducer wodurch sich die Bakteriengemeinschaft wieder erholen kann
Wie kann man Autoinducer zur Behandlung von Pathogenen nutzen?
Bakterium Blautia obeum produziert DPO
DPO ist ein Autoinducer die die Besiedlung durch Vibrio cholerae inhibert
Quorum Sensing der Pathogene wird gestört —> Veränderte Kommunkation, Veränderte Genexpression, …
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