Was sind die drei grundsätzlichen Schritte der Zellteilung?
cell elongation
septum formation
completetion of septum, formation of celll wall, cell seperation
Wie ist der grunsätzliche Ablauf der Zytokinese in E. coli?
Chromosomreplikation und Volumen der Zelle nimmt zu
Segregation der Chromosomkopien
Formation des Z-RIngs und tethering
Ring findet Position genau in der mitte der Zelle
ftz Protein bindet Filament, semikontinuierlich
Ring rekrutiert andere Teilungsproteine (divisome)
Peptidoglykansynthesen werden aktiv
Konstuktion und Synthese des inward septums
Kompletion der Zytokinese
Zell-Separation
Was sind die Phasen des bakteriellen Wachstums und was passiert da jeweils?
Lag Phase
frisch angeimpft
Bakterien gewöhnen sich an neue Bedingungen
langsames Wachstum
Expotentielle Phase
Teilungsprozess findet stat
expotentielle Zunahme an Zellen
stationäre Phase
kein Wachstum mehr
Resistenzen, etc. werden ausgebildet
Sterbephase
Zellen sterben
stellen Nährstoffe für andere Zellen dar
Welches Protein ist essentiell für die Zellteilung und Viabilität in rod shaped Bakterien?
FtsZ
Was kann die FtsZ- Mutante nicht und welche folgen hat das?
keine Ringformation
keine Zellteilung
—> Filamentöse Zellen die langfristig nicht überleben
Wovon ist FtsZ-Polymerisaierung abhängig?
GTP-abhängig
FtsZ ist sein eigenes GTP-aktivierendes Protein
Hydrolyse von GTP findet erst statt nachdem die Untereinheiten mit dem Profilament in Konakt getreten sind
Erkläre den Porzess der Polymerisierung von FtsZ in Anwesenheit von GTP.
Polymerisierung von FtsZ ist ein dynamischer Prozesse
durch Hinzufügen von GTP polymerisieren die Monomere zu einem Filament
wenn GTP gespalten wird zerfällt das Filament
es kommt immer was dazu und es geht immer was weg
(eine Art Fluss der Organisation)
von der einen Seite kommt eine neue Unterinheit dazu und von der anderen Seite verschwindet sie
Wozu führt die GTP-Hydrolyse?
dass sowohl FtsZ- als auch Tubulinfilamente eine gekrümmte Konformation annehmen
Wie verhält sich der Peptidosynthasekomplex während der Polymerisierung?
PG synthase-Komplex wandert mit dem FtsZ Komplex hinterher
in der Bewegung entsteht neues Zellwandmaterial
der Ring zieht sich weiter zu und irgendwann ist die Zelle gespalten
Welcher Zusammenhang steht zwischen Wachstumsfortschritt der Zell und der Menge an FtsZ die benötigt wird.
je weiter die Zelle wächst desto weniger FtsZ wird benötigt
FtsZ ist ein zytoplasmatisches Protein und kann von alleine nicht an die Zellwand binden. Welche Interaktionspartner braucht FtsZ um an die Zellwand binden zu können und den Proto-Ring zu bilden?
FtsA
bindet an die Membran über eine C-terminale amphipathische Helix
FtsZ bindet dann an andere Seite
wie ein flexibler Membranhaltegurt
ZipA:
ist verankert in der Membran über N-terminale transmembran Domäne
interagiert mit FtsZ
—> nächster Schritt: der Proto ring rekrutiert Enzyme für die Zellwandsynthese
Welche alternativen “Membranhalterungen” (FtsA) für FtsZ gibt es in anderen Bakterien?
SepF in B. subtilis (hat FtsA) und Mycobacteria (kein FtsA)
Welche zwei Systme regulieren die Positionierung von FtsZ in der Mitte der Zelle?
Min System: verhindert Z-Ring an den Polen
Nucleoid occlusion (NO): inhibiert Z-Ring assembly nahe am Nucleoid
vermittelt durch Noc oder SlmA
Wodurch wird NO in E. coli und in B. subtilis vermittelt?
Noc in B. subtilis
SlmA in E. coli
Erkläre was man unter negativer Selektion für die Positionierung von FtsZ versteht.
Min System und NO wandern zwischen den Polen hin und her
FtsZ lagert sich nur an der Position an wo diese zwei Mechanismen nicht sind —> in der Mitte
so wird verhindert dass sich FtsZ an den Polen bildet und dass die Zellteilung beginnt bevor die Chromosomenteilung abgeschlossen ist
Wozu führt dei Deletion der min Gene?
Mini Zellen bilden sich da Abschnürung nicht in der Mitte stattfindet
Was machen die Einzelnen Bestandteile des MinCDE Systems?
MinD ist eine dimerische ATPase die über eine amphipatische Helix an die Membran bindet und dann MinC rekrutiert
MinC ist der Inhibitor des Z-Ring Assemblys indem er die Länge der Protofilamente kürzt
MinCD osziliiert zwischen den Zellhälten in 40-50 sec Intervallen
MinE induziert die ATPase-Funktion von MinD und die Membranablösung —> formt eine zirkuläre Struktur welche dem MinCD-Komplex Enden folgt
Wozu führt die Überproduktion von MinC?
inhibiert asaambly von FtsZ
Was würde bei Abwesnehit von MinE passieren?
Bei Abwesenheit von MinE geht die oszillatorische Eigenschaft des Systems verloren und das MinCD System ist gleichmäßig über die Membran verteilt
Wie hängen Nukleoid Verschluss und FtsZ-Lokalisierung zusammen?
wenn die Replikations-Maschenerie das letzte drittel des Chromosoms erreicht hat, entsteht eine Nukleoid-freie und Min-freie Zone in der Mitte der Zelle
dadurch kann FtsZ sich in der Mitte der Zelle anlagern
wenn die Replikation vollständig ist und die SchwesterChromosomen segregiert sind, wird der Rest der Zellteilungsmaschenerie aufgebaut
Was ist die Ter-Region
the replication terminus region
Welche Funktion haben SlmA in E. coli und Noc in B. subtilis
wirken der Z-Ring Bildung über der DNA entgegen
sie können mit DNA-binding domains interagieren, welche spezifische DNA-Sequenzen im Chromosom erkennen
Wie beeinflussen die Noc binding sites die Teilungsmaschenerie in B. subtilis?
es gibt 70 Noc-binding sites im B. subtilis Chromosom
nur an den Ter regionen befinden sich keine Noc-binding sites
nur wenn die Noc-freie Terminus-Rgion repliziert wird und die Noc-bindende Region von der Mitte der Zelle wegbewegt wird, kann die Zellteilungs-Maschenerie anfangen
Was ist SlmA in E- coli?
SlmA ein DNA-assoziierter Teilungsinhibitor, der direkt an der Verhinderung der Z-Ring-Assemblierung auf Teilen der Membran, die das Nukleoid umgibt, beteiligt ist
Was hätte die Deletion von Noc und SlmA zur Folge?
—> Division Septum kann sich über unsegregierte Nucleoide formen
Aus welchen Bausteinen ist Noc aufgebaut?
N-terminale amphipathische helix
linker
Arginine-reiche Box I und Box II Region
HTH-DNA binding Domäne
C-terminal dimer Domäne
Wo erfolgt die Noc-Bindung an der DNA?
Noc-Molekül-Brücke breitet sich an der esamten DNA aus um eine kompakte Sturktur nahe der Membran zu formen
das verhindert die Polymerisierung von FtsZ Molekülen in der Umgebung
Was macht SlmA?
erweitertes SlmA Molekül breitet sich an der DNA aus und bindet FtsZ C-Enden und hält die FtsZ Protofilamente fest
Was ist das Grundprinzip der positive Regulation der Z-Ring Positionierung? Nenne drei Beispiele.
bestimmte Moleküle (unterscheiden sich pro Organismus) sammeln sich in der Mitte der Zelle und rekrutiern FtsZ an die Stelle wo es hin soll
SsgB/SsgA in Streptomyces spp.
PomZ in Myxococcus xanthus
MapZ ind Streptococcus pneumonia
Was macht MapZ in Streptococcus pneumoniae?
—> positiver Regulation
MapZ positioniert FtsZ in der Mitte der Zelle
MapZ RIng spaltet sich in zwei Ringe die sich voneinander weg bewegen wenn PG-Synthese beginnt
dritter MapZ Ring formt sich in der Mitte gefolgt von FtsZ in mehreren Ringen die mit den MapZ Ringen an den division sited überienstimmen
Regulation von MapZ phosphorilierung durch StkP und PhoP tritt in der Mitte der Zelle auf und reguliert FtsZ-Ring Aufbau
Wie wird die Divisome Aktivität durch DNA-Schäden reguliert?
DNA-Schäden (z.B. durch UV) verurschen Einzelsträngige DNA die als Polymerisationsebene für RecA dienen
autoproteolysiertes RecA stimuliert die Autoproteolyse der SOS Transkriptions-Repressors LexA
LexA-Regulon enthält auch ein Zell-Teilungs-Inhibitor —> SulA (Verhinderung der Weitergabe der mutierten DNA)
SulA inhibiert spezifisch die Polymerisierung von FtsZ indem es an das FtsZ-Monomer bindet
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