Eckichi

• Genkartierung (Familien -> Lokalisation)

• Gen Identifikation (Klonierung -> Gene -> Mutation)

• Beobachtung von Genetischen Rekombinationsereignissen

  => Karte aufgrund der Rekombinationshäufigkeiten. Abstand in cM

• Logarithmus des odds-ratio

• Statistisches Maß für Kopplung

• Lodscore > 3 Annahme von Kopplung

• Lodscore < -2 Ausschluss von Kopplung

• Genetische Marker durch SNPs

• wird untersucht wo welches Allel wie häufig vorkommt

• Aufdeken von Allel mit Mutation

  
  

• Nicht nur Genetik für Phänotyp entscheidend

  => Auch die Umwelt hat Einfluss

• nicht nur Genetik entscheidend für Phänotyp

  => Auch Umelt hat Einfluss

• z.B. Eineiige Zwillinge haben Unterschiede

• Der Einfluss der Umweltfaktoren unterscheidet sich von Krankheit zu Krankheit

Errechnung des Risikos für Geschwister eine Erbkrankheit zu bekommmen

• Kopplung:

  • besteht zwischen 2 Genorten (Loci)

• Assoziation:

  • besteht zwischen Allelen (also Ausprägungen oder Varianten von Genen) (an gekoppelten Loci)

  => beschreibt das häufigere gemeinsame Auftreten zweier Gene als statistisch angenommen

• Bei unterschiedlichen Betroffenen aus unterschiedlichen Familien werden theoretisch unterschiedliche Ursachen vermutet

• Aber wenn viele Familien mit erkrankten Kindern, kann ein gemeinsames Allel gesucht werden

• Können gemeinsame Vorfahren haben, aber die Information darüber fehlt

  => Genetische Assozationsanalysen, um mögliches Allel zu finden, das die Erkrankten gemeinsam haben könnten.

  => Muss Krankheit nicht auslösen, kann sie aber begünstigen => Anhaltspunkt

• Über viele Generationen hinweg werden Genpositionen durch Rekombination verändert

• Es gibt immer wieder ursprüngliche Marker, die auf SNPs beruhen

• Wenn Gene unerwartet oft/selten miteinander rekombiniert werden, dann könnte Kopplung bestehen

• Wenn mehrere Betroffene derselben Krankheit den selben Marker haben, dann kann entscheidendes Gen in der Nähe liegen        

• Solche Genomweiten Analysen zb. mit GWAS (genome-wide Association Studies)

Exomsequenzierung Probleme:

• Verpasste Mutationstypen (Splice site Mutationen)

• Strukturelle Mutationen

  • große Deletionen

  • große Insertionen

  • große Inversionen

  • große Duplikationen

  • große Translokationen