3’ und 1’ der 20 AS?
Zeichnen können:
R, W, Y, D, E, N
Welche AS lassen sich untereinander austauschen, ohne dabei die Eig. v. Protein stark zu verändern bei:
Glu
Ser
Val
Lys
Gly
Asn
Aromatisch
neg. geladene (sauer): Asp , Glu
hydrophile, aliphatische (-OH): Ser, Thr
hydrophobe, aliphatische: Val, Leu, Ile
pos geladene. (basisch): Lys, Ar, (in bestimten Fällen: Histidin auch pos.)
unpolar, kleine: Ala, Gly
polar Amid-SK: Asn, Gln
aromatische (in einigen Fällen): Phe, Tyr, Trp
Cys einzigartig, da Ausbildung SS-Brücken
Pro: einzigartig, da durch zyklische SK Helixbrecher -> stört Stabilität in Sekundärstruktur, da keine H-Brücken-Stabilisierung möglich
Die AS N (Aspargin) kann unter Umständen schwierig sein für ein Protein. a.
Was passiert da?
Bei welchen Bedingungen? 1 nennen
Deamidierung (Amidgruppe sehr labil): Amidgruppe v. Asparagin wird in Carboxylgruppe umgewandelt -> Umwandlung v. Aspargin (Asn) in Asparaginsäure (Asp)
(kann auch bei Gln zu Glu passieren)
Bedingungen:
erhöhter pH-Wert (alkalisch)
hohe Temp
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