Pour qu’une protéine soit fonctionnelle….
Pour qu’une protéine soit fonctionnelle, elle doit être transcrite, traduite puis régulée par des modifications post- traductionnelles telles que la liaison avec une autre protéine, la phosphorylaVon, la glycosylaVon, etc
(Ces protéines sont parfois des facteurs de transcripVons qui eux-même peuvent être régulés)
Comment ont peut induire une réponse cellulaire ?
Les niveaux d'expression des protéines vont répondre à quoi ?
La cellule modifie l'environnement… explications + donner des exemples.
Une fois qu'une cellule a intégré les signaux extérieurs, elle va modifier les signaux qu'elle renvoie.
Par exemple, la cellule hépatique va stocker du glycogène, l'adipocyte va stocker des triglycérides, etc.
Les cellules inflammatoires vont sécréter des cytokines en réponse à des stimulations (virus, etc)
La cellule va également modifier ses interactions avec la matrice extracellulaire et avec les autres.
Ainsi, la cellule reçoit et émet des signaux à l'extérieur.
Notions de cancerogenèse
1. Mutations de l'ADN (« drivers) +/- prédispositions génétiques
Parmi les mécanismes expliquant le cancer, nous avons premièrement le déclenchement de mutations de l'ADN
( dans le gène « driver » = 1er évènement pathologique ) par
des facteurs chimiques, des rayonnements ou encore des
Rayonnements (RX, UV ...) virus (ex: le HPV à l'origine du cancer du col de l'utérus chez la femme).
-Il y'a +/- prédisposition génétique que ce soit au niveau de
la mutation d'un gène ou d'un polymorphisme génétique
facilitant la survenue de ces altérations.
2 & 3. Promotion - Prolifération
La mutation va permettre une prolifération incontrôlée de la cellule ce qui va conduire à une accumulation d'anomalies moléculaires dans la cellule au fur et à mesure du développement du cancer. On parle donc d'hétérogénéité cellulaire dans le cancer.
4. Dissémination- Métastase: Détachement des cellules et implantation
Le risque le + important est finalement la dissémination et la métastase due à la « libération des cellules »: elles
vont rompre leurs attaches et pouvoir s'implanter dans d'autres tissus (métastase).
La cancérogenèse affecte un des aspects du « destin cellulaire »
Mécanisme pouvant être perturbés lors d’un cancer :
1) Activ permanente des circuits de prolifération cellulaire
2) Inactivation des gènes supp de tumeurs
3) Activ des capacités d'invasion et de metastase
4) Actv de l’immortalisatiob et activation des telomerases
5) angiogenes
6) inactiv de l’apoptose
Decouverte du 1er oncogene ( explications + histoire…)
Quel gène est responsable de la prolifération anormale ?
Le gène src qui était responsable de cette proligère et qui avait une fonction tyrosine kinase ( c'est elle qui en est responsable)
Gène similaire à un oncogene chez l'homme ?
- En comparant la séquence de ce gène avec la séquence humaine, on a retrouvé dans le génome un gène similaire.
- Ce gène étant présent dans une cellule normale, ne pouvait pas être appelé un « oncogène » puisqu’il n’avait pas
exactement la même séquence. On parle donc de « proto-oncogène cellulaire: c-src ».
- C-SRC est un gène normal cellulaire qui code une protéine cellulaire à activité tyrosine kinase.
Si le gène qui code la protéine à activité tyrosine kinase est muté :
Cependant, si ce gène est muté et n’est plus régulé c’est-à-dire si l’acVvité tyrosine kinase est en permanence
activé , le fonctionnement normal de la cellule est alors remplacé par un fonctionnement anormal: A de la mobilité favorisant l’angiogenèse, A survie et A proliféraVon par sVmulaVon des MAPK kinases).
Un proto-oncogène qui est un gène normal peut muter et devenir un oncogène responsable d’une prolifération anormale.
Ou le proto-oncogène avait été trouvé initialement ?
Les anti-oncogene : ex + explications du mécanisme
Quelques exemples de gènes anti-oncogènes:
-p53 presque tout les cancers
-BRCA1 BRCA2 cancers du sein
Explications ??
Epigenetique def
Marque epigénétique :
Methylation de l’ADN
Modifications post-trad des histones : methylation, acetylatio, phospho….
MicroARNs rôle
Régulation de l'expression des gènes
Description des ARNs ( 6)
Les microARNs description (4)
Concernant la maturation des microARNs où on les trouvent ?
Soit regroupes en clusters dans des séquences particulières du génome ( bout à bout) .
Soit à l'intérieur des gènes, dans des régions introniques.
Qui transcrit la séquence qui donne des pre-microARNs et quelle est leur structure ?
ARN poly II + ils ont une structure en épingle à cheveux
( ils vont être maturé en microARN)
Etape de la première maturation :
- Il va y avoir une première matura=on de ces pré- microARNs dans le noyau avec une ribonucléase qui va cliver les régions non importantes et libérer un pré- miRNA + court organisé en épingle à cheveux.
- Cette séquence va sortir
r du noyau au travers d’un pore nucléaire grâce à l’exportine 5 + Ran-GTP et se retrouver dans le cytoplasme.
Achèvement de la maturation étape et explications:
Une fois qu’il y’a eu reconnaissance par complémentarité des bases, il peut y avoir…
2 types de conséquences lorsque le complexe RISC se fixe sur un ARN cible:
1. Inhibition de la traduction on (situation la + fréquente) si c’est un ARNm
- cette inhibiVon de la traducVon se fait en régulant soit les séquences 5’ soit les séquences 3’ de l’ARN. - Cela peut empêcher la fixaVon de facteurs de traduc=on, dégrader la queue polyA de l’ARN par
dissociaVon de la PABPC (polyA Binding Protein) qui se fixe dans la parVe 3’ et stabilise l’ARNm.
Les microARNs peuvent etre exportés expliquez comment ?
- Cependant, ils peuvent aussi être exportés de
la cellule: soit associés à des protéines de
transport comme AGO1-4 ou des lipoprotéines
(telles que les HDL ou les LDL) qui peuvent
porter ces molécules, soit inclus dans des
vésicules de différentes tailles: corps
apoptotiques, vésicule sécrétée, exosome.
Résumé des mécanismes d’action desmicroARN :
Pq les microARN se retrouvent à la surface des cellules ?
car il y’a des récepteurs à a surface des cellules qui vont faire que les microARN vont être transférés d’une cellule à une autre (cela fait partie d’un des moyens de communications de la cellule) permettant la transmission d’informations et la régulation d’autres cellules par le biais de ces microARNs.
MicroARNs et pathologie
régulent des gènes et des voies
impliquées dans la différenciation, prolifération, maladies cardiovasculaire
On a pu montrer que des microARNs pouvaient etre à l’orugine de cancers en activant des oncogèbes et inactivant des anti-oncogènes .
En med on peut utiliser les microARNS sous forme :
Def epigénétique 2
Marques epigenetique de l’ADN chez les mammifères :
Methylation des cytosines
Concernant la Methylation des cyrosines :
Ou se trouve la Methylation ?
La Methylation disparaît si
Il n’ya pas d'activité de methyl transferase de maintien
Important de reconnaître le brin mère :
DNMT = ADN méthyltransférase 1 ( particularité )
Syndrome ICF
Suppression de DNMT3A
Les cellules ne sont plus capables de s'adapter correctement à leur environnement.
Lorsqu’on désactive DNMT3A:
Les cellules expriment IFN gamma et IL-4 à la fois : elles ne sont plus differenciées
Par quoi passe la Methylation et la demethylation ?
Methyla—> par une prot
Demethyla—> par la reparation de l’ADN
4 modif possible au nc de la cytosine :
Ou se trouve les methyles de chaque brin ? En général quand on methyl l’ADN il se passe quoi ?
cote à cote sur le grand sillon + quand on methyl on inhibe l'expression des gènes.
Donneur de methyl universel nom ?
Les Methyl bindingprot recrute un certain nombre de prot appelés ? elle recrute aussi quoi ?
Quand l’ADN est complètement methylé il ya —-> ?
influence directe ?
influence indirecte ?
Bilan
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