Régulation de génome

transcriptionnelle

Entre 2000 et 3000 gènes

• Les Enhencers —> activatrice

• Les Silencers —> inhibiteur

de plus toutes les séqences cis-régulatrice sont reliées par un médiateur

elle a pour but de de démétyler les guanosines

donc trop cool pour les traitements de tumeur parce que le traitement veut méthyler les guanosines pour tuer les celllues infectées

seulement chez les PRO

groupe de gène sous l’influence d’un même promoteur

Pour l’exemple du des gènes de la digestion du glucose et du lactose

Le but est de fixer le prot CAP sur le promoteur lier à de l’AMPc

• le lactose inhinbe le la protéine de répression

• le glucose inhibe l’AMPc

└> cela nous a appris qu’il faut qu’une ARNpol se fixe sur un promoteur pour que la transcription commence

• Zinc finger

• Leucine zipper : partie qui se lie à l’ADN est basique => charge positive

• Homeodomaine ou Hélice-boucle-hélice

tétramère

peut activer ou désactiver plusieurs gènes différent

• Acylation : rétire les charges postive des lysines des histones —> décompaction

  Recrutement des protéines à bromodomaine qui déclanche une réaction en chaine

  • HAT —> décompaction

  • HDAC —> compaction

• Méthylation : méthyle la fonction amine des lysines

  • KMT —> méthyle

  • KDM —> déméthyle

cela conduit a une expression hémizygote

Exemple IGF2 :

Répresison de l’allèle maternel et expression de l’allèle paternel

• maman pas méthylé donc expression de CTCF —> H19 réprime IGF2

• papa exprime IGF2

• Tumeurs de Wilms (néphroblastome)

  méthylation de la mère

  └> enhancers accessibles —> double expréssion d’IGF2

• Syndrome de Silver-Russel (RCIU)

  déméthylation du père

  └> blocage de l’accès aux enhancers —> pas de d’IGF2 du tout —> problème lors du développement embryonnaire

sont régulés par l’environnement et peuvent être

• hydrosoluble —> récepteur membranaire

• liposoluble —> récepteur nucléaire

• oncogènes —> un seul et la maladie se déclanche

• suppesseurs de tumeur —> il faut muter les 2 pour inactiver le gène

méthylation des zones mCpG —> transformation de la cytosine en 5-methylcytosine

liaison répresseur MeCP 1/2

└> recutement de HDAC —> déacétylation des histones —> condensation de la chromatine —> répression de la transcription

permettent la fixation des protéines SR (sérine et arginine)

favorise le recrutement du spliceosome

sont à l’interieur d’exon —> ils empèchent le reccrutement du spliceosome

normalement c’est gène de 29 exons qui dans le foie donne l’ApoB100

mais dans l’intestin il y a un enzyme : la cytidine désaminase APOBEC intestinale

ApoB48

l’enzyme ADAR permet de changer les A en I qui sera lu comme un G

└> cela va rendre le neurone mature

• les ARNsi : d’origine exogène

  • sont double brins

• le miARN : d’origne endogène

  • sont simple brin

    • qui sont à l’origne de 30% de la régulation des ARNm

    • sont a 40% codé dans les introns

    • regroupé en cluster

    • taille d’envion 21 à 24 nuclétotides

└> il sont éfficasse en : inhibant l’a traduction des proténines, en coupant la queue poly A ou en clivant directement l’ARN mais pour cela il faut un complémentarité parfaite

à chaque fois il y a recrutement de AGO prot argonaute et toujours en 3’UTR

de 200 à 10 000 nucléotides

pol II

éponge à miARN et respnsable de la lyonisation des chromosmes X

—> c’est lncARN Xist qui fait ça

il sont des éponges à miARN

mais aussi se lie en leurant les protéines du ribosome

extremement stable

chez le EU il faut recruter la petite unité du ribosome par la coiffe et la protéine CAP

les protéines elF4E se fixe sur CAP et permet la tradution mais en situation normale elle est séquestrée dans le par 4E-BP1

Il faut phosphorylée 4E-BP1 pour pouvoir le détaché de elF4E

celui qui phosphoryle c’est mTOR en réponse à de nombreux facteurs

le but est la prolifération cellulaire

les séquences IRE vont fixées des protéines IRP (aconitase) qui cachent le gène de la ferritine, si il y a du fer —> la ferritine est transcrite

soit on utilise la ferritine

• est les inhinbé par les aconitases en 5’UTR

• elle stocke le fer et sont composé de 24 SU

soit on utilise la transferrine

• elle est boostée par la fixation des prots IRP en 3’UTR

• permet quand il y a peu de fer d’en faire rentrer dans la cellule

la maladie de l’exès de fer s’appelle l’hémochromatose

souvent fait par des enzymes et cela peut donner de nouvelle fonction à la protéine :

• interaction prot/prot ou prot/ADN

• activité enzymatique

• ++ stable

• localisation dans la cellule

518 et parmis celle-ci 17% sont de tyrosine kinase et le reste de sérine thréonine kinase

je le phosphoryle puis la phosphorylation va êstre reconnu par une ß-arrestine qui induit l’endocytose du recepteur

facteur de transcrition qui va s’activé en cas d’hypoxie

└> cela va activer l’angiogénèse

qui dit facteur de transcription il a donc forcément un domaine de liaison à l’ADN et un domaine de transactivation

Si les prolines sont hydroxylés alors il y a une dégradation de HIF1-α

VHL ou Von Hippel-Lindau

maladie autosomique dominante peut aussi être somatique

au sein du cervelet, de la moelle épignère et de la rétine

c’est ce qui fait les groupementxs ABO

soit par le lysosome (par le chinois en 2016) :

soit par le protéasome (apr le non chinois en 2004) :

• le complexe reconnait l’ubiquitine (portéine de 76AA —> 8500 Da, globulaire sauf en 4AA en C-term)

• la mono et la multi-ubiquitination on des rôles de méssager cellulaire

• la poly-ubiquitination permet la reconnaissence de la protéine par les 2 SU 19S du protéasome pour ensuite la dégrader

• pour ubiquitiné il faut E1 qui recrute l’ubiquitine puis transfert sur un E2 puis grâce à E3 j’ubiquitine ma protéine sur les lysines

délétion partielle du chromosome 15 qui induit un perte de la ligase E6-AP

└> se qui implique une non dégradation des protéines car elles ne sont plus ubiquitiné

la protéine MDM2

ubiquitine en permanace la protéine P53 se qui permet d’avoir une réponse très rapide en cas de problème

et c’est la protéine ARF qui va séquestré MDM2 en cas de signale de mort cellulaire

ceux qui inhibe la voie mTOR sont la rapamycine et le vérolimus