Systematik

Reinkultur

Traditionell:

• Mikroskopisch

• Phyiologisch

• Chemotaxonomie

  • Fettsäurenzusammensetzung

Modern:

• Phylogenetisch

  • 16S-rRNA (<97% eine Art)

  • DNA-DNA-Gesamthybridisierung (<70% eine Art)

  • WGS (whole genome sequence)

  • ANI (average nucleotide identity) >95%

Analyse der Gene eines Biotops/einer Lebensgemeinschaft

• Euryarchaeota

• Crenarchaeota

• Nanoarchaeota

• extrem halophile

  • Halobacterium

  • Photosynthese durch rotes Archaeorhodopsin

• methanogene

  • zur Energiegewinnung

  • CO2 + 4H+ -> CH4 + 2H20

• hyperthermophile

  • Thermoplasma

  • Thermococcus

  • Archaeoglobus

• Sulfulobus

  • erzeugen Schwefelsäure

• Pyrodictium

  • bei Tiefseevulkanen bei 121 °C

• marine psychrophile Arten

  • in Polarmeer

  • 
    

• besiedeln andere Archaeen außen

  • Epibionten

• Firmicutes (niedriger GC-Gehalt)

• Actinobacteria (hoher GC-Gehalt)

teils Endosporenbildner (z.B. Bacillus)

• Bacilli

  • aerob, fakultativ aerob oder aerotolerant

  • Milchsäurebakterien (Streptococcen)

  • Staphylococcus

• Clostridia

  • obligat anaerob

  • Clostridium tetanus

  • Clostridium botulinum

• Mollicutes

  • ohne Zellwand

  • Mycoplasma

  • kleinstes Genom

• Propionibacterium -> Käse (anaerob)

• Bifidobacterium -> in Darmflora, besondere Gärung, anaerob

• CMN-Gruppe:

  • Corynebacterium

    • Diphterie

    • Glutamatproduktion

  • Mycobacterium

    • TBC (Tuberkolose)

    • Lepra

  • Nocardia

    • Boden

    • Abbau organischer Verbindungen