Distanzmatrix-Methoden
Was sagt die Distanzmatrix?
UPGMA
UPGMA-Problem
Molekulare Uhren
Neighbor-Joining (NJ)
Vorgehensweise NJ
Berstimmen der Topologie beim NJ
Berechnen der Astlängen beim NJ
Distanzmethoden: UPGMA vs. NJ
Charakter-orientierte Methoden
Was sind Charaktere?
Maximum Parsimony (MP)
Grundbegriffe MP
MP - Beispiel
MP - verschiedene Verfahren
MP Exhaustive Search
MP tree search - Branch and bound
MP tree search - Heuristische Verfahren
Nearest neighbor interchange (NNI)
Subtree pruning and regrafting (SPR)
Tree bisection and reconnection (TBR)
long branch attraction
MP - Vor- und Nachteile
Zuletzt geändertvor 2 Jahren
