Welche Möglichkeiten gibt es für den Mechanismus der DNA-Replikation
Semikonservative Replikation
Konservative Replikation
Dispersive Replikation
Jedes Tochtermolekül enthält eine Polynucleotidkette vom ursprünglichen Molekül und einen neu synthetisierten Strang
Konservative Replikation:
Ein Tochtermolekül enthält beide elterlichen Poly nukleotide und das andere zwei neusynthetisierte Stränge
Dispersive Replikation:
Die Stränge des TochterMoleküls bestehen teilweise aus ursprünglichen und teilweise aus neu synthetisiertem Polynukleotid
Replikationsursprung/Origin
• Replikations-Initiations-Proteine erkennen DNA-Sequenzen und führen zu einer Unterbrechung der Basenpaarungen in diesem Bereich
• Die freigelegten Einzelstränge können nun als Matrize für den Kopiervorgang dienen
Welches “Problem” tritt bei der Replikationsgabel auf?
Die DNA Synthese erfolgt immer in 5´ nach 3´ Richtung:
Es entsteht einmal der Leitstrang, welcher quasi in die Replikationsgabel hinein läuft.Der zweite, neusynthetisierte Strang (Folgestrang) läuft aus der Replikationsgabel hinaus und es kommt zur Bildung von Okazaki-Fragmenten.
Was ist die PCR?
Enzymatische DNA-Vervielfältigungsmethode, bei der in mehreren Amplifikationsrunden Primer entlang einer Matrizen-DNA verlängert werden. Dabei wechselt die Temperatur periodisch, so dass die DNA immer wieder denaturiert wird und sich die Primer erneut anlagern und verlängert werden können.
Was versteht man unter Amplifizierung
Prozeß, in dem die Anzahl der Kopien eines bestimmten DNA-Moleküls in einer PCR vervielfältigt werden
Was versteht man unter Amplikon
DNA-Abschnitt, der in der PCR vervielfältigt wurde.
Wer ist Arthur Kornberg
Nobelpeis 1959
Isolierung eines Enzyms, das an einer Polynukleotidmatritze DNA synthetisieren konnte (DNA-Polymerase I)
Wie funktioniert die Polymerase 1
• Enzym addiert Desoxyribonukleotide an das freie 3´-OH-Ende der zu verlängernden Kette
• Polymerase katalysiert den nucleophilen Angriff des 3´-OH-Endes des Primers auf das a-Phosphoratom des dNTP
• Ein aktives Zentrum welches alle vier dNTPs binden kann
• Eine hohe Wahrscheinlichkeit für die Verknüpfung nur, wenn das neueintretende Nukleotid mit dem Nukleotid des komplementären Stranges ein Watson-Crick-Basenpaar bilde
• Die DNA-Polymerase prüft das Ergebnis jedes von ihr katalysierten Polymerisationsschrittes bevor sie mit dem nächsten fortfährt
• Die DNA-Polymerase entfernt falsch gepaarte Reste am Ende des Primers, bevor die Polymerisation fortschreitet
Was macht die Exonuclease
Was macht die Exonuklease
Hierdurch wird der Primer entfernt (anschließend durch DNA ersetzt)
Warum verkürzt sich ein Strang bei der Replikation
Weil der letzte RNA-Primer nicht mehr in DNA umgeschrieben werden kann (abgebaut wird)
-> Bei der nächsten Replikation verkürzt sich auch der andere Strang (komplementärer Strang) es entsteht ein verkürztes Telomer
Bei jeder Zellteilung werden Chromosomen an ihren Enden (Telomere) kürzer Wenn eine bestimmte Länge/Kürze erreicht ist, teilen sich die Zellen nicht mehr
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