Beschreiben Sie die Vorgänge während der Replikation bei Prokaryoten. Nennen Sie dabei die in der Vorlesung vorgestellten, beteiligten Faktoren sowie deren Aufgabe. (4 P)
DNA Doppelstrang wird durch helikase entwunden und geöffnet
Einzelstrang bindende Proteine (verbessern Primer anyling) halten sie offen -> soll für Primase und Polymerase 3 zugänglich bleiben.
Primase setzt an Leit und Folgestrang an und syntethisiert kurze Primer. Diese werden von Polymerase 3 gebraucht um Folgestrang zu syntetisieren.
Synthese erfolgt in 5´3´ Richtung weil DNA Polymerase den Strang in 3´5´richtung liest.
Tochterstärnge werden immer von 5´3´Richtung gebaut weil sie entgegengesetzt der Helikase läuft.
Primase setzt Primer an 3´Ende von Mutterstrang und Polimerase wandert dann in 3´5´Richtung hinterher.
Bei Folgetrang wandert Polimerase entgegen der Aufspaltungsrichtung der Helikase. Setzt somit imer enue Primer und DNA Polimerase syntisiert immer das Stück dazwischen.
Es kann nur in eine Richtung am Stück syntetisiert werden -> Leitsrang. Am Folgestrang bilden sich Okazaki Fragmente
DNA Ligase verknüpft Okazaki Fragmente nachde, DNA Polimerase 1 dissoziiert ist.
Unterschiede Mitose /Meiose (kurz)
Mitose
Meiose
Asexuelle ungeschlechtliche Fortpflanzung
geschlechtliche Fortpflanzung
erzeugung von Klonen
Nachkommen unterscheiden sich von Eltern
keine Rekombination
rekombination
somatische Zellen
Geschlechtszellen
2 diploide Tochterzellen entstehen
4 haploide Tochterzellen entstehen
Kernteilung mit Prophase, metaphase, Anaphase und Telophase ohne crossing over
jeweils 2 davon
Mitose ausführlich
Mitose und Interphase abwecshlnd
Interphase besteht aus G1, S und G” Phase
G1: Alle Zellen werden arretiert, die sich nicht teilen
S: Replikation der DNA -> X Form entsteht 8verdopplung von Organellen)
G2: arretierung von Zellen mit DNA Schäden
Prophase:
spindelapparat wird gebildet ( Centrosomen wandern zu Polen)
Schwesterchromatide sinhd sichtbar
Kerhülle beginnt sich aufzulösen
Metaphase:
Chromosome ordnen sich an Äquatorialplatte an
Spindeln setzen an Schwesterchromatiden an
Kernhülle ist komplett aufgelöst
Anaphase:
Schwesterchromatide werden zu den Polen gezogen
-> vorliegen als Chromosom
Telophase:
2 Kerne werden gebildet (Chromosome darin)
Spindelapparat wird abgebaut
Chromosome gehen wieder in zusatdn von nicht kondesierter DNA
Cytokinese (Zellteilung) findet statt) (teils auch nach der Telophase)
Zusammenfassung:
Chromosomen werden verdoppelt -> Schwesterchromatide entstehen
Chromatide werden auf 2 Tochterzellen verteilt
2 identische diplode Tochterkerne entstehen und werden auf 2 Zellen verteilt
Meiose ausführlich
Meiose 1 und Meiose 2
1 2n Mutterzellen -> 4 1n Tochterzelle
Meiose 1
Prophase1:
Synapsis: homologe Chromosomen heften sich zusammen -> Crossing over -> genetische Vielfalt
Metaphase1:
Spindeln setzen diesmal an Chromosomenpaaren an und ziehen ganze Chromosomen auseinander
Anaphase1:
Telophase1:
In jeder zelle jetzt nur 1n!
Aus 1x 2n jetzt 2x 1n
Meiose 2
keine Interphase weil haploide Mutterzeööe
Prophase2:
keine Synapsis -> crossing over nicht
Metaphase2:
Spindeln setzen diesmal an Chromatiden an -> wie Mitose
Anaphase2:
Telophase2:
Chromosome gehen wieder in zustand von nicht kondesierter DNA
2 haploide mutterzellen ( 2 Chromatid Chromosomen) -> 4 Haplode Tochterzellen (1 Chromatid Chromosomen)
unterschiede und Gemeinsamkeiten von induzierbaren und reprimierbaren Operons von E.coli. je ein bsp
Funktionsweise Lac operon:
Repressor liegt an Operator gebunden vor. Wenn Laktose kommt, aktiviert es repressor und der gibt operator frei.
Bindung verhindert die tranksription der lac gene.
Lactose bindet an repressor und inaktiviert ihn. _> Operator wird frei
RNA Polymerase kann jetzt an operator binden und gene ablesen. Diese transkribieren für 3 Proteine.
Diese 3 Proteine können Lactose spalten -> Glucose und diese markieren
Zelle verwertet lieber glukose. -> dann findet transkription normal statt.
Wenn weniger Glucose vorliergt, bildet sich CAMP Komplex der sich vor den Promotor legt und die herstellung der proteine steigert -> Mehr laktose wird abgebaut zu glukose.
Funktionsweise trp Operon:
normal wird mRNA transkribiert und Gene für Tryptophan abgelesen -> trp Bildung.
Trp aktiviert dan repressor -> lagert sich an operator an und stoppt das ablesen.
induzierbare Operons
reprimierbare Operon
kodieren Enzyme für einen Stoffwechselweg
kodieren Enzyme die an Biosynthese beteiligt sind
z.b. lac operon
z.b. trp Operon
Von Substrat des Stoffwecshelweges reguliert, das Abbau induziert
Von produkt des Reaktionsweges reguliert
repressor wird gebildet und ist aktiv,
kann durch induktoren inaktiviert werden
repressor wird gebildet, ist inaktiv und wird mit co rezeptor aktiv
Promotor + regulatorsiches gen für Repressor
Promotor + regulatorisches Gen für Repressor
Promotor + strukturgene für Enzyme
Promotor + Stukturgene für Enzyme
Gemeinsamkeiten:
codieren für StrukturGene für Enzyme und besitzen Promotor,
haben regulatorischens gen für repressor/Promotor
Unterschiede:
beim induzierbaren Operon liegt der repressor anfangs aktiv vor und muss inaktiviert werden, beim reprimierbaren operon liegt er inaktiv vor und muss aktiviert werden.
induzierbar wird von substrat reguliert, was dessen abbau induziert. Bei reprimierbaren wird es vom reaktionsprodukt reguliert
induzierbar kodiert für Stoffwechselenzyme
reprimierbar kodiert für Enzyme der biosynthese
Das folgende Diagramm zeigt die vereinfachte Struktur eines Globin-Gens, schematisch in 8 Segmente (A – H) unterteilt. Das Gen besitzt 3 Exons, 2 Introns, einen Promotor und ein Polyadenylierungssignal. (4 P)
a) Welche/s Segment/e erscheint/erscheinen in der prä-mRNA?
b) Welche/s Segment/e erscheint/erscheinen in der reifen mRNA?
c) Welche/s Segment/e wird/werden in der reifen mRNA zusätzliche Nukleotide aufweisen? Um welche Zusätze handelt es sich dabei?
d) Welche/s Segment/e enthält/enthalten die CCAAT- und TATA-Boxen?
e) Welche/s Segment/e enthält/enthalten das Polyadenylierungssignal?
f) Welche/s Segment/e enthält/enthalten das Translations-Initiations-Codon?
A
Promotor (B)
Exon 1 C
Intron 1 D
Exon 2 E
intron 2 F
Exon 3 G
H
prä-MRNA
Promoto, introns und exons
reife mRNA
nur Exons
Exon weißt 5´Cap auf
letztes Exon weißt Poly A Schwanz auf
Promotor enthält die CAAT und TATA Boxen
Polyadenylierungssignal ist auf letzter stelle und leitet abschneiden der mRNA ein nach dem Poly A Schwanz
Beschreiben Sie stichwortartig die Methode der Polymerasekettenreaktion (PCR).
-PCR=Polymerasekettenreaktion
-zur Amplifizierung bzw Vervielfältigung von DNA Zielsequenzen
-für die DNA werden DNA, DNA-Pol. (Taq-Pol.), Primer und Nukleotide (dNTPs) gebraucht
-DNA-Molekül auf 94°C denaturieren -Gemisch auf 50°C abkühlen, damit Primer an denaturierte einzelsträngige DNA binden
-dNTPs und DNA-Polymerase dazugeben → Synthese neuer DNA-Stränge bei 72°C →72°C optimale Temperatur für die Synthese mit einer Taq-Polymerase (aus hitzeliebenden Bakterien
-dieser Vorgang wird wiederholt, nach jedem Durchgang hat sich die DNA-Menge verdoppelt -nach 20 Zyklen über 500.000 Moleküle
-nach 30 Zyklen beendet -aus der ursprünglichen DNA entstehen lange Produkte mit Überhängen -nach dem zweiten Durchgang verkürzen sich die Produkte
-nach dem dritten Durchgang sind kurze Produkte entstanden, die exponentiell angereichert werden
southern blot
-southern blot = zur Analyse von DNA-Fragmenten
-z.B. für die Unterscheidung verschiedener Spezies
→unterschiedliche Spezies sind in nicht-codierenden Bereichen wenig konserviert, besitzen dort also viele Mutationen →diese Sequenzen können nach einem southern Blot miteinander verglichen werden -Gel in basische Lösung geben
→ DNA denaturieren
-Nylonmembran über Gel legen
→ nimmt DNA auf
→ Abklatsch/Blot entsteht
- Nylonmembran mit Blot wird in eine Lösung mit radioaktiv markierten Sonden gelegt -Sonden sind komplementär zur Zielsquenz und hybridisieren
-freie Sondenmoleküle warden abgewaschen -
Southern Blot ist entstaden und wird mit Röntgenfilm sichtbar gemacht → Röntgenfilm lässt die mit markierter Sonden hybridisierte DNA sichtbar warden
Benennen Sie die Bereiche im TI-Plasmid von Agrobakterium tumefaciens, die an der Infektion von Pflanzenzellen beteiligt sind.
-Die ausgeschnittene T-DNA, da diese in die verletzte Pflanzenzelle und das genetische Material integriert werden.
-Die vir-Gene, da diese Proteine erzeugen die die T-DNA ausschneiden sowie einen Pilus zwischen dem Agrobakterium und der Pflanzenzelle bilden.
Welche dieser Bereiche müssen verändert werden, damit eine gezielte Transformation von Pflanzen erfolgen kann? Beschreiben Sie den Ablauf der Erzeugung transgener Pflanzen. (4 P)
Einfügen des Konstuktes in MCS ( künstliche Anordnungn von basenpaaren zum Klonen)
T-DNA muss verändert werden
Promotorsequenz wird benötigt um DNA in Pflanze dann exprimieren zu können
Selektionsmarker für Resistenzen muss in T-DNA sein
vir Gene der werden ersetzt durch ori von E. Coli ( ori ist replikationsursprung), Ori von tumefaciens bleiibt erhalten
Selektionsmarker wird integriert -> für transformation von beiden Bakterien mit Bakterienpromotor
Vektor enthält dann genetische infos und Signale zum schneiden der T- DNA aber keine vir Gene um das auch durchzuführen
Überführung des Vektors in E.Coli um sich dort zu vermehren
Danach wire der vektor aus E. Coli isoliert und in A. tumefaciens überführt.
Dort liegt vir Gen vor. das schneidet T-DNA aus ermöglicht Pilus bildung zur Pflanzenzelle
T-DNA gelangt in Pflanzenzelle und wird in Genom dauerhaft eingebaut
vir gen wird von Phenol angeregt ( phenol entsthet wenn Pflanzen verletzt sind)
binärer Transofrmationsvektor: trennung der vir gene vom Vektor und Nutzung von helferplasmid, damit es bei unfall nicht eigenständig in der Umwelt agieren kann
Worin unterscheiden sich „cisgene“ von „transgenen“ Pflanzen?
In cisgenen Pflanzen werden nur arteigene Gene, Gene von verwandten Pflanzenlinien, eingebracht. Das isolierte Gen, das in die Pflanze eingebracht werden soll, stammt von der gleichen Pflanzenart.
Bei der Erzeugung trangener Pflanzen werden Gene artfremder Organismen übertragen, wie es z.B. mit einem binären Klonierungsvektor und A.tumefachiens gemacht werden kann.
vor uns nachteile von herbizid resistenten Pflanzen
Vorteile:
Kosten und Zeit ersparnis von Personal durch häufige unkrautreinigung
höherer ertrag der Nutzpflanzen
erhöhung der stressresitenz von pflanzen
nachteile:
Multiresistente Unkräuter können durch Kreuzung entstehen
mögliche krebserregende Stoffe der Einsatzmittel
Nennen Sie Beispiele für den Einsatz von Produkten aus im Wasser lebenden Organismen außerhalb des medizinischen Bereichs (mindestens 4). Aus welchem Organismus stammt das jeweilige Produkt?
-Herstellung von Klebstoffen anhand von Byssusfäden von Muscheln
-Schutzanstriche für Schiffe o.ä. auf Basis von Proteinen aus Muscheln
-Gefrierschutzproteine aus Fischen (z.B. Lachs) können Pflanzen frostunempfindlicher machen
-Bekämpfung von Mikroorganismen mit Schutzstoffen aus Korallen
-Polykultur: Stickstoffhaltige Verbindungen aus den Ausscheidungen von Fischen (Tilapien) können direkt zur Düngung von Pflanzen (Salat) genutzt werden
Welche Teile des Genoms werden für den genetischen Fingerabdruck verwendet? Warum sind andere Teile weniger gut geeignet? Welche Vorsichtsmaßnahmen müssen bei der Probennahme eingehalten werden?
Es werden VNTRs benutzt die auf nicht codierenden bereichen liegen und von mensch zu mensch unterschiedlich sind
Man nutzt nicht codierende EInheiten da in codierenden bereichen weniger Mutationen haben und damit weniger individuell sind.
VNTRs sind meist sich wiederholende Einheiten wie GTGTGTGTGTGTG
Anzahl der Wiederholungen ist unterschiedloich. Man bekommt von Vater und Mutter eine. Wie unterschiedlich lang die Einheiten sind, kann mit gelelektrophorese deutlich gemacht werden.
kürzere laufen weiter als lange.
Man nutzt dabei 3 Paare von homologen Chromosomen, welche 6 Banden bilden.
-> genetishcer Fingerabdruck -> wird in Forensik eingesetzt
Bei der Probenentnahme muss sehr Kontaminationsarm gearbeitet werden. -> keine Sporen, Pilze oder andere DNA.
Wie werden monoklonale Antikörper hergestellt? Nennen Sie zwei Beispiele für die Anwendung in der Diagnostik (3 P)
besitzen nur eine einzige Bindungseigenschaft
ein Ag wird eine Tuer gespritzt sodass es in Bauchspeicheldrüsen AK bildet.
Bauchspeicheldrüsenzellen werden isoliert und mit Krbszellen (myelomzellen) fusioniert.
Hybridomzellen werden in mangelmedium selektiert und von Bauchspeicheldrüsen zellen getrennt.
Dann kultiviert und diese scheiden nun AK aus die auf ein AG reaktiv sind.
positiv getestete Klone werden eingefroren und später genutzt
Diagnostik von krebszellen
Therapie als Immunsuppressivum
Erläutern Sie den Unterschied zwischen „Therapeutischem“ und „Reproduktivem“ Klonieren an Hand von Anwendungsbeispielen. (2 P)
therapeutisches Klonieren:
Endprodukt: undifferenzierte Stammzellen
genetisch passend weil Spender = Empfänger
krankes Gewebe kann ersetzt werden
benötigt wenige Wochen
Patientenspezifische Stammzelltherapie
Reproduktives Klonieren:
klonierter Mensch als Endprodukt
Embryo wird erschaffen und in Leihmutter implantiert
9 Monate
Duplizierung von lebewesen
Aus einer Eizelle wird der Zellkern entnommen und der einer Körperzelle eingebaut
klonale Zygote entsteht
Vermehrung bis Embryo
therapeutisches Konieren:
Embryo entwickelt sich zu Blastozyste woraus embryonale Stammzellen entnommen werden. Diese werden später weitrer entwickelt und in Spender zurück implantiert für verschiedenes gewebe
reproduktives Klonieren:
neuer Mensch nach 9 Monaten
Was versteht man unter dem Begriff „Gentherapie“? Beschrieben Sie an Hand eines Beispiels, welche Verfahren eingesetzt werden können.
Genetisches material wird in Körper eingebracht um dort Defekt auszugleichen.
wird in somatische (Köroerzellen) und nicht in generative zellen (Gameten) eingebracht.
2 verfahren:
Ex-Vivo Therapie:
Gewebe wird aus dem Körper genommen und Zellen werden isoliert und in Zellkultur vermehrt.
Gesunde gene weerden in kranke Zellen eingebracht und die neuen gesunden zellen vermehren sich.
dann zurück in z.b. Leber in Körper
In-Vivo:
Gene werden direkt in Viren als Vektor in den Körper geschleust
Dort geben die Viren die DNA an die Zellen ab
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