Definition Anabolismus und Katabolismus
Anabolismus: Aufbau Biomoleküle
Katabolismus: Abbau Biomoleküle, Energiegewinnung
Wie differneziert man Coenzyme?
fest gebunden an Enzym--> prosthetische Gruppe
nicht fest gebunden--> Cosubstrat
Welche Vitamine wasserlöslich und welche fettlöslich?
wasserlöslich: Vitamin B und C
fettlöslich: Vitamin A, D, E und K
Was ist das besondere an NADH und NADPH im Vergleich zu NAD+ und NADP+? Für Analytik?
NADH und NADPH absorbiert im UV Bereich bei 340 nm
biochemische Tests um indirekt Enzymaktivität zu erfahren
GlykolyseWo? Edukt zu Produkt allgemein?Welche Bedingungen?Nettogewinn?
Wo: Cytosol
1 GLucose zu 2 Pyruvat
unter aeroben und anaeroben Bedingungen bis zum Pyruvat (danach nicht mehr)
Nettogewinn: 2 ATP und 2 NADH
Glykolyse: alle 10 Reaktionen, Edukt und Produkt und Enzym
Glucose --> Glucose-6-phosphat (Hexokinase, ATP Verbrauch)
Glucose-6-phosphat <--> Fructose-6-phosphat (Glucose-6-phosphat-Isomerase)
Fructose-6-phosphat --> Fructose-1,6-bisphosphat (Phosphofructokinase, ATP Verbrauch)
Fructose-6-Phosphat <--> Dihydroxyacetonphosphat und Glycerinaldehyd-3-phosphat (Aldolase)
Dihydroxyacetonphosphat <--> Glycerinaldehyd-3-phosphat (Triosephosphat-Isomerase)
Glycerinaldehyd-3-phosphat <--> 1,3-Bisphosphoglycerat (GA3P-DH, NAD+/NADH)
1,3-Bisphosphoglycerat <--> 3-Phosphoglycerat (Phosphoglycerat-Kinase, ATP Gewinn)
3-Phosphoglycerat <--> 2-Phosphoglycerat (Phosphoglycerat-Mutase)
2-Phosphoglycerat <--> Phosphoenolpyruvat (Enolase)
Phosphoenolpyruvat --> Pyruvat (Pyruvat-Kinase, ATP Gewinn)
Glykolyse: nenne die beiden Reaktionen der Substratkettenphosphorylierung mit Strukturformeln
Glykolyse: die 3 Schlüsselenzym und deren Reaktionen mit Strukturformeln und welches davon Schrittmacherreaktion
Glykolyse: wie wird Phosphofructokinase 1 reguliert? 3 Stoffe zum Hemmen und 2 Stoffe zum aktivieren
Hemmen: Citrat, ATP, NADH
Aktivieren: Fructose-2,6-bisphosphat (via PFK2), ADP/AMP
Molekül mit größtem Phosphatgruppenübertragungspotential
Phosphoenolpyruvat
Welche 3 Anschlussreaktionen von Pyruvat und welchen Bedingungen?
Pyruvatdecarboxylierung/oxidative Decarboxylierung: Wo? Unter welchen Bedingungen? Grundreaktion? Welche Enzyme? Beteiligten Coenzyme?
wo: in Mitochondrienmatrix
Bedingungen: aerob, irreversibel
Grundreaktion: 2 Pyruvat zu 2 Acetyl CoA und 2 NADH
E1: Pyruvat Dehydrogenase
E2: Dihyrolipoyl Transacetylase
E3: Dihydrolipoyl Dehydrogenase
Pyruvatdecarboxylierung: alle wichtigen Reaktion ausführlicher
Pyruvat über E1 zu CO2 und TPP-C2
C2 auf Liponamid in E2 und Acetyldihydroliponamid
Acetyl und CoA-SH zu Acetyl-CoA
FAD zu FADH2 in E3
FADH2 zurück regeneriert zu FAD, da NAD+ zu NADH und H+
Citratzyklus: Alle Reaktionen mit Strukturformeln und Enzymen (8 Reaktionen)
Citratzyklus: Was ist das besondere an Aconitase?
Aconitase mit Fe4S4-Zentrum
irreversible Reaktion von Citrat zu Isocitrat
Citratzyklus: was ist das besondere an alpha-Ketoglutrat-Dehydrogenase?
irreversible Reaktion von alpha Ketoglutarat zu Succinyl CoA
Multienzymkomplex
E1: alpha Ketoglutarat Dehydrogenase
E2: Dihydrolipoyl Succinyltransferase
Wo ist Succinyl-CoA-Synthetase wichtig?
in Hämbiosynthese
Citratzyklus Reaktion in Konkurrenz mit Prophyrinsynthese Glyin + Succinyl CoA --> delta Aminolävulinat
Porphyrie
Import und Export von Kompenten im Citratzyklus
einzige Substratkettenphosphorylierung in Citratzkylus
Schlüsselreaktion in Citratzyklus
irreverisbel
Isocitrat zu alpha Ketoglutarat durch Isocitrat-Dehydrogenase
NAD+ zu NADH und H+
CO2 abgespalten
Welche 4 Enzyme zu Regulation von Citratzyklus und oxidativer Decarboxylierung? Plus welche allosterische Modulation
Komplex I oxidative Phosphorylierung
NADH Ubichinon Oxidoreduktase
Tranpsort von H+ in Intermembranraum
NADH + H+ zu NAD+ und in dem Zuge FMN zu FMNH2 (2 e-)
dann in einzel Elektronentranport über FeS-Zentren (bilden ein Kanal) zu Ubichinon (Q)--> zu Ubihydrochinon (QH2)
Komplex II oxidative Phosphorylierung
Succinat Ubichinon Oxidoreduktase
kein H+ Transport
Succinat zu Fumarat
2e- und FAD zu FADH2 und wieder zurück
freie e- über FeS-Zentren zu Ubichinon (Q)--> reduziert zu Ubihydrochinon (QH2)
Komplex III oxidative Phosphorylierung
Ubichinol Cytochrom c Oxidoreduktase (Cytochom bc1 Komplex)
H+ Transport in Intermembranraum
drei Untereinheiten: Cytochrom c1, Cytochrom b, Rieske-Eisen-Schwefel-Protein
Q Zyklus mit 2 Halbzyklen
1. Halbzyklus: QH2 ein e- an FeS-Cluster und an Häm von Cytochrom c1--> e- dann an lösliches Cytochrom c Molekül am Intermembranraum + 2H+ Transport--> zweites e- auf Häm bL und Häm bH und danach auf Q--> Semichinon-Radikalanion
2. Halbzyklus: 2e- von QH2 auf 1. Halbzyklus, aber viertes e- auf Semichinon-Radikalanion-->in Matrix QH2
Netto: 2H+ in Intermembranraum, Elektronen auf löslichen Cytochrom c als Verbindungselemnt zum Komplex IV
Komplex IV oxidative Phosphorylierung
Cytochrom c Oxidase
Oxidation von Cytochrom c durch Elektronenübertragung auf Sauerstoff unter Bildung von Wasser
Struktur: 2 Cytochrom c Oxidase Einheiten--> jede Einheiten aus 3 Untereinheiten
Untereinheit I mit Häm a, Häm a3 und CuB als Redoxzentrum
Untereinheit II mit CuA aus 2 Kuperferionen
Unterinheit III kein Redozentrum
4-mal gibt Cytochrom c 1e- an CuA--> weiter an Häm a und Häm-a3-CuB-Komplex (binukleäres Zentrum)
Fe-Cu-Zentrum für Reduktion des Sauerstoffs
Komplex V oxidative Phosphorylierung
ATP Synthase
Kopfteil = F1-Teil = ragt in Matrix
Stiel Komponente = F0-Teil = sitzt in innerer Mitochondrienmembran--> besitzt mebrandurchspannenden Protonenkanal
Protonengradient sorgt für angetriebenen Protonenfluss durch F0--> das ist gekoppelt mit der ATP Synthese in F1
drei aktive Zentren für ATP Synthese--> nie in gleicher Konformation
O Konformation (open)--> ADP und Pi binden--> Drehbewegung von Untereinheit gamma um 120° gegen Uhrzeigersinn
L Konformation (loose)--> SUbstrat mehr an aktives Zentrum, kein Verlassen möglich
nächste Rotation (120°) sorgt für ATP Synthese in T Konformation (tight)
anaerobe Reaktionen nach Glykolyse
Glykolyse klassisch
alkoholische Gärung: Pyruvatdecarboxylase macht aus Pyruvat--> CO2 und Acetaldehyd, Acetaldehyd und NADH zu Ethanol durch Alkoholdeyhdrogenase
Milchscäuregärung: Pyruvat zu Lactat durch NAD+ abhängige Lactatdehydrogenase
Cori Zyklus
gebildetes Lactat per Glykolyse und Milchsäuregärung aus Muskel in die Leber
in Leber dann Gluconeogenese
ATP aus Oxidation von Fettsäuren
Gluconeogenese: Wo? Bilanz? Welche drei Enzyme aus GLykolyse für irreversible Reaktionen?
Wo: in Mitochondrienmatrix und Cytosol und glatten ER--> nur in Leber und Niere
Bilanz: 2 Pyruvat + 4 ATP + 2 ATP + 2 NADH --> 1 Glucose
Umkehrung der Glykolyse
drei irreversible Schlüsselreaktionen der Glykolyse durch vier Umgehungsreaktionen in Gluconeogenese ersetzt (ansonsten waren Reaktionen reversibel)
3 Enzyme aus Glykolyse: Pryuvatkinase, Phosphofructokinase, Hexokinase
Gluconeogenese: 4 Umgehungsreaktionen und alles wichtige zum Tranposrt ins Cytosol
Pyruvat zu Oxalacetat durch Pyruvat Carboxylase (Biotin, ATP Verbrauch, CO2 als Nebenprodukt)--> dann über Malat Dehydrognese zu Malat--> Transport aus Mitochondrienmatrix--> Tranport durch Malat-alpha Ketoglutarat-Antiporter--> in Cytosol über Maladehydrogenase wieder zu Malat
Oxalacetat zu Phosphoenolpyruvat durch Phosphoenolpyruvat-Carboxykinase unter GTP Verbrauch (CO2 als Nebenprodukt)
Fructose-1,6-bisphosphat zu Fructose-6-phosphat durch Fructose-1,6-bisphosphatase (Pi weg)
im glatten ER: Glucose-6-phosphat zu Glucose durch Glucose-6-phosphatase (Pi weg)---> Glucose raus aus Zelle
Gluconeogenese: Reaktion von Pyruvat zu Oxalacetat alles wichitge
Gluconeogenese: wichtigsten Enzyme und Schlüsselenzym und wie sie reguliert werden
Pruvat Carboxylase: ADP aktiviert, Acetyl CoA hemmt
PEP Carboxykinase: ADP hemmt
Fructose-1,6-bisphosphatase (Schlüsselenzym): F2,6bP und AMP hemmen, Citrat aktiviert
Glucose-6-phosphatase: Glucose-6-phosphat aktivert
Gluconeogenese: Einfluss von Glucagon auf bifunktionelles Enzym von PFK-2
PFK-2: Einmal Phophofructokinase Domäne und einmal Fructose-1,6-bisphosphatase Domäne
Glucagon aktivert GPCR--> PKA steigt--> cAMP steigt--> hohes cAMP aktiviert Furctose-1,6-bisphosphatase Domäne--> Gluconeogenese gefördert
Insulin agiert genau entgegengesetzt--> cAMP sinkt--> Phophosfructokinase Domöne wird aktiviert--> Glykolyse steigt
4 Substrat der Gluconeogenese
Pyruvat
Lactat (Cori Zyklus)
Aminoäuren--> Pyruvat
Glycerin--> Überführung in Dihydroxyacetonphosphat
Pentosephosphatweg: Wozu? Wo? Schlüsselreaktion/Schlüsselenzym? Bilanz?
Wozu: Schnittstelle zu Glykolyse (nimmt Glucose-6-phosphat)--> gibt Stoffe in Glykolyse/Gluconeogese oder Nukleotidsynthese
Schlüsselreaktion/Schlüsselenzym: Glucose-6-phosphat zu 6-Phosphogluconolactonase durch Glucose-6-Dehydrogenase
Bilanz: Glucose-6-phosphat als Ausgangsstoff, 2 NADPH rausziehen für Fettsäurebiosynthesen
Pentosephosphatweg und welche Substrate als Schnittstelle zu anderen Zyklen?
Struktur Ribose-5- Phosphat und Ribulose-5-phosphat
Gluconeogense: oxidativer Teil
Gluconeogense-nicht oxidativer Teil
Ribulose-5-phosphat entweder zu Ribose-5-Phosphat (Ribulose-5-phosphat-Isomerase) oder zu Xylulose-5-phsphat (Ribulose-5-phosphat-Epimerase)
Tranketolase: C2 Transfer mit Carbonylgruppe, TPP(Thiaminpyrophosphat) als Coenzym
Transaldolase: C3 Transfer mit Carbonylgruppe
Glucose-6-phosphat-Dehydrogenase Mangel
Schlüsselenzym Pentosephatweg
nicht ausreichend NADPH
NADPH regeneriert Glutathion normalerweise
Erythrozyten sterben--> Mangel führt zu hämolytische Anämie (Favismus)
Fructose-2,6-bisphosphat als wichtiger Regulator der Glykolyse und Gluconeogense
Phosphofructokinase 2 Enzym
Struktur von Glykogen
kleiner Proteinkern: Glykogenin
darum wickeln sich Kohlenhydratketten mit alpha-1,6 und alpha-1,4 glykosidischen Bindungen
Glykogensynthese: Wo? Edukt und Produkt? Alle wichtigen Enzyme (4)? Schlüsselenzym/reaktion?
wo: Cytosol
Edukt: Glucose/Glucose-6-phosphat
Produkt: Glykogen
Glucosephosphat-Mutase
UDP-Glucose-Pyrophosphorylase
Glykogen-Synthase: Schlüsselenzym--> UDP-Glucose zu Glykogen
branching enzyme: Amylo-alpha-(1,4-->1,6)-Transglykosylase
Glykogensynthese: Mechanismus der Glucosephosphat Mutase
Glykogensynthese: UDP-Glucose-Pyrophosphorylase
Glykogensynthese: Einfluss von Insulin und Glucagon/Adrenalin
Insulin--> weniger cAMP--> weniger PKA--> aktiviert Phosphatase--> Phosphatase sorgt dafür, dass Glykogen-Synthase dephosphoryliert und somit aktiviert wird
Glucagon--> an GPCR--> mehr cAMP--> PKA aktiviert--> Glykogen Synthase wird phosphoryliert und somit gehemmt
De novo Synthese von Glykogenpartikeln
Glykogenolyse: Wo? Edukt und Produkt? Schlüsselenzym? Welches Coenzym?
Wo: Cytosol (und glattes ER)
Edukt: Glykogen
Produkt: Glucose-6-phosphat/ Glucose
Schlüsselenzym: Glykogen Phosphorylase (Spaltung von alpha-1,4-glykosidischer Bindung)--> PLP als Coenzym
Glykogenolyse: alle Enzyme und grob den Verlauf
Glykogenolyse: wie wird Glykogenphosphorylase durch Insulin und Glucagon/Adrenalin beeinflusst?
Insulin hemmt Glykogenolyse/Glykogenphosphorylase--> aktiviert PP1--> desphosphoryliert Phosphorylase--> inaktiv
Glucagon aktiviert Glykogenolyse/Glykogenphosphorylase--> aktiviert PKA über cAMP--> aktiviert Phosphorylase Kinase--> phsophoryliert Phosphorylase--> aktiv
Morbus Pompe
Glykogenspeichererkrankung
reduzierte Aktivität/Mangel an sauer Maltase (alpha-1,4-Glucosidase)
verstärkte Glykogenspeicherung
wenig Glucose--> schädigt Glucobedürfte Organe
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