Wie ist die DNA aufgebaut?
Doppelhelix:
rechts herum gedreht
Zwei gegenläufige Stränge
-> antiparallel
3’ gegnüber 5’
Phosphat-Zucker-Moleküle bilden Rückgrat
Phosphodiesterbindung
Zucker: Desoxyribose (Pentose, am C2 Atom fehlt OH-Gruppe)
5’ - Phosphatgruppe
3’ - OH-Gruppe an C3
Basen:
Pyrimidinbasen: Thymin und Cytosin
Purinbasen: Adenin und Guanin
Paarung A:T und G:C (Pyrimidbase + Purinbase)
-> A:T und C:G in gleichen äquimolaren Mengen
Verbindung durch Wasserstoffbrücken; A:T = 2 H-Brücken; G:C= 3 H-Brücken
Über 80°C brechen HH-Brücken und DNA denaturiert
Nukleosid: Base + Zucker
Nukleotid: Base + Zucker + Phosphat (= Nukleosidmonophosphat)
dNTP’s: Desoxyribonukleotide
Wie liegt die DNA im Zellkern vor?
DNA ist negativ geladen und von Histonen und Nichthiston-Proteinen umgeben
DNA + Protein = Chromatin
DNA-Faden um Histone gewickelt und bildet Nucleosomen
Histone sind positiv geladen und ermöglichen enge Wicklung
Histone sind basische Proteine
Was sind Euchromatine und Heterochromatine?
Euchromatin
Heterochromatin
DNA als locker Faden im Zellkern -> nicht sichtbar
DNA stark kondensiert -> sichtbar unter Lichtmikroskop
Während der Interphase -> Transkription möglich
Während Mitose/Meiose -> keine Transkription
Basische Histone sind acetylisiert, sodass DNA für Enzyme der Transkription zugänglich sind
DNA ist fest um Histone gebunden
Was ist die Replikation?
Def: Replikation ist die identscihe Verdopplung der DNA
erfolgt semikonservativ
Synthesercihtung immer von 5’ zu 3’
Doppelhelix aus altem und neuen Strang entsteht (Mutter und Tochterstrang)
Während der Interphase (S-Phase)
Vor jeder Mitose/Meiose
3 Schritte
Initiationsphase
Elongationsphase
Terminationsphase
Polymerase benötigt für Replikation immer DNA-Matrizenstrang, dNTP’s und Primer
Durch Didesoxynukleotide (ddNTP’s) wird Elongation abgrebrochen
Wie genau laufen die 3 Phasen der Replikation ab?
Initiation
Helicase bindet am DNA und entwickelt diese und löst H-Brücken
Einzelstrangbindungsproteine stabilisieren Einzelstränge und verhindern so neue Verbindung
Primase bildet RNA-Primer
Topoisomerase verhindert “Supercoiling”
Elongationsphase - Leading Strang
Anlagerung von freien dNTP’s nur am 3’-Ende, daher nur Syntetisierung in 5’-3’ möglich
Elongation durch DNA-Polymerase
verschiede DNA-Polymerasen
ε- und δ-DNA-Polymerase Verlängerung
Elongationsphase - Gegenstrang
ständig neue Primer setzen für Ansatzpunkt für DNA-Polymerase
Primerbildung durch Primase (RNA-Polymerase), die kurze RNA-Stücke synthetisiert
-> DNA Polymerase kann so dNTP’s an 3’Ende anfügen
Strang besteht aus Okazaki-Fragmenten (Einzelstücke) -> sind durch DNA-Ligase verbunden
Primerabbau erfolgt durch Nuklease: RNA-Primer wird durch dNTP’s ersetzt
Helicase wird blockiert und Replikation wird beendet
Wie lassen sich die beiden DNA-Stränge unterscheiden?
Kontinuierlicher Strang = Leitsrang (leading strand)
Syntheserichtung: 5’ -> 3’
Einmaliges Priming
Diskontinuierlicher Strang = Folgestrang (lagging strand)
Bildung von Okazaki-Fragmenten
mehrmaliges Primen
Übersicht Enzyme der Replikation
Topoisomerase: Strangbruch -> verhindert super coiling
Helicase: Entwindung des Doppelstrangs
Primase: Synthese des RNA-Primers (Startermolekül)
DNA-Polymerase (nur 5’-3’): Synthese des komplementären Strangs; bei lagging strand auch Primer Verlängerung
DNA-Ligase: Verknüpfung neuer DNA-Fragmente
Was sind Telomere?
Telomere:
An Enden befinden sich gleichartige Nucleotidsequenzen (repetetive Sequenzen; TTAGGG)
Wird Primer entfernt, keine Synthese neuer DNA-Stücke
Durch Nukleasen werden Enden (Telomere) immer kürzer
-> führt irgendwann zu Zelltod
> Grund für Alterung
Telomerase
bildet neue Telomere
nur in Keimzellen, Stammzellen und embryonalen Zellen
Wie erfolgt die Genreperatur?
Excisionsreperatur:
Endonuklease: entfernt defekte Sequenz
DNA-Polymerase: ersetzt defektes Stück
DNA-Ligase: verbindet neues DNA-Stück mit alten Abschnitt
Unterscheidung zwischen:
Endonuklease: schneidet mitten in DNA-Strang
Exonukleasem: bauen DNA von Ende her ab
Wie erfolgt die Genexpression?
Exons und Introns:
Aufbau aus Exons (codierend) und Introns (nicht codierend):
97% sind Introns ca. 3% sind nur codierend
Introns werden durch Splicing entfernt
Prokaryoten und Mitochondrien besitzen keine Introns
Vor Genen befindet sich ein Promotor
Transkription:
Bildung hn-RNA
Durch Prozessierung mRNA
Translation:
Bildung eines Promotors
Wie ist die RNA aufgebaut?
RNA:
einzelsträngig
in RNA statt Desoxyribose: Ribose
Statt Thymin: Uracil
RNA-Typen:
hnRNA: heterogene nukleäre RNA = präRNA; im Kern)
mRNA (Kern -> Zytoplasma)
rRNA (Ribosomen)
t-RNA (Translation)
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