Was bedeutet Lithotroph?
Anorganischer Elektronendonator (Substrat)
Photolithotroph: Energie von Sonne
Chemolithotroph: Energie durch chemische (Redox-)Reaktionen
Lithoautotroph: anorganische C-Quelle (CO2)
Häufig
Wie sieht der Stickstoffkreislauf (Stoffwechselwege) aus?
Nitrifizierer
aus 2 Teilreaktionen
Teilreaktionen von unterschiedlichen physiologischen Gruppen durchgeführt
Auswaschung von Nitrat aus Böden
Ansäuerung zerstört Gebäude
Oxidation zu Nitrat und Salpetersäure (HNO3)
Ammoniumoxidierer
Nitrosomonas, Nitrosococcus, Nitrosospira
Schlüsselenzym: Ammonium-Monooxygenase!
baut Sauerstoff in Ammonium ein
Membrangebunden
Braucht 2 e-
Nitritoxidierer
Nitrobacter, Nitrococcus
Nitrit-Oxidase
Was ist das Schlüsselenzym der Ammoniumoxidation der Nitrifikation und welche Reaktion katalysiert sie?
Ammonium-Monoxygenase
Oxidiert Ammoniak zu Hydroxylamin und reduziert Sauerstoff und 2 Protonen zu Wasser
membrangebunden
Braucht 2 Elektronen aus Q-Komplex
Substrat der Umsetzung zu Nitrit ist Hydroxylamin (NH2OH), da NH4+ schwer zu aktivieren ist
Hydroxylaminreduktase
Eigentliche Energielieferung (4 Elektronen)
Wie konservieren Ammoniumoxidierer Energie?
Ammonium-Monoxygenase oxidiert Ammonium mit 2 Elektronen aus Q-Zyklus zu Hydroxylamin
Hydroxylamin wird von Hydroxylaminreduktase mit Wasser zu Nitrit und 5 Protonen oxidiert
4 Elektronen auf Cyt c übertragen
2 Elektronen davon auf Q-Zyklus für Ammonium-Oxigenase
abh. Von Protonengradient aufgrund NADH
2 Elektronen auf Cyt aa3, welche O2 und Protonen zu Wasser reduziert und 2 Protonen pumpt
Wasserstoff-Gradient abh. ATPase
Wie konservieren Nitritoxidierer Energie?
Nitritoxidoreduktase oxidiert Nitrit mit Wasser zu Nitrat und Protonen
Sauerstoff oxidiert
Protonengradient für ATPase
Wie sind Ammoniumoxidierer biotechnologisch relevant?
Kläranlage
entfernen Ammonium durch Oxidatzu Nitrat
Denitrifikation reduziert Nitrat zu N2
Auf welche Wege kann Sulfid (HS-) oxidiert werden?
Sox-System
zu Sulfat
SQR-Wege (Sulfid-Quinon-Oxidoreduktase):
Sulfitoxidase und Sulfit-DH
Sulfid zu Sulfit und dann zu Sulfat
umgekehrte Sulfatatmung mit APS-Reduktase
Anammox
Anaerobe Ammoniumoxidation
Ammonium (Donor) mit Nitrit (Akzeptor) zu Stickstoff und Wasser
im Anammoxosom
kompartimentiert entstehendes Hydrazin (N2H4)
beinhaltet ATPase in Membran
Ladderan-FS
Zyklischer Prozess
Nitritreduktase
reduziert Nitrit mit 2 Protonen und 1 Elektron zu Wasser und NO
Hydrazinsynthase
Reduziert Ammonium mit 2 Protonen, 3 Elektronen und NO zu Wasser und Hydrazin
Hydrazin-DH
oxidiert Hydrazin zu N2, 4 Protonen und 4 Elektronen
Schwefeloxidierer
Mit Sulfid oder Schwefel
meist aerob
teilweise mit Schwefelspeicher (Riesenbakterien)
Saurer oder neutraler pH
Gradientenorganismen
zwischen oxisch und anoxisch
Bewegen sich zu Substratkonzentrationen/Luft
teilweise auch Nitratreduktion (Thioploca) mit Nitratspeicher
Was ist das Sox-System?
Periplasmatisches Enzymsystem zur Oxidation reduzierter Schwefelverbindungen
Elektronen auf Stufe des Cyt c in die Atmungskette
stufenweise Oxidation von Schwefelwasserstoff
Energiekonservierung der Schwefeloxidation
reverser Elektronentransport für NADH-Produktion möglich
Protonengradient mit ATPase
Knallgasbakterien
Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)
oxidieren H2 zu 2 e- und 2 H+
reduzieren (0,5) O2 mit 2 e- und H+ zu Wasser
Schlüsselenzym: Hydrogenase (oxidiert H2) in Membran
minimale Atmungskette:
Ionentranslozierendes, membranständiges Enzym (Hydrogenase)
(terminale Oxidase) Cyt a gibt Elektronen an Sauerstoff ab
ATPase
Cytoplasmatische (lösliche) Hydrogenase reduziert NAD+ für Anabolismus
kein reverser Elektronentransport notwendig!
Redoxpotenzial von H2 negativer als von NAD+!
Was sind PHBs?
Poly-ß-Hydroxybuttersäuren
Speicherstoff für C in Bakterien
Eisenoxidation
bei saurem oder neutralen pH
saurer pH macht Fe(II) löslich
Acidithiobacillus
thermoacidophile Archaeen
Bei neutralem pH Fe(III) nur an einer Stelle von der Zelle ausgeschieden (Rostfaden)
Gallionella
4 Fe(II) + O2 + 4 H+ -> 4 Fe (III) + 2 H2O
Fe(III) + 3 (OH)- -> Fe(OH)3
Aerobe Eisenoxidation bei neutralen pH – Formulieren Sie die Reaktionsgleichung. Skizzieren Sie eine Zelle von Gallionella ferruginea und erläutern Sie anhand dessen das Problem der Zellen und dessen biologische Lösung.
Biochemie Fe(II)-Oxidation bei saurem pH
Fe(II) von Cyt c in äußerer Membran oxidiert
Cyt c überträgt 2 Elektronen auf Rusticyanin auf der inneren Membran
Kurze Elektronentransportkette (3 cyt) reduziert Sauerstoff und transloziert Protonen
alternativ: reverser Elektronenfluss zur NAD+-Reduktion
ATPase mit Protonengradient
Wozu kann Eisenoxidation genutzt werden?
Erzlaugung mit Acidithiobacillus
oxidiert Fe(II) von Pyrit (FeS2)
Metallsulfid oder elementarer Kupfer wird so freigesetzt
Boden kann sauer werden
Boden kann mit giftigen Metallen verseucht werden
Warum kann Acidiobacillus ferrooxidans nicht schon das H+- Potential der Umgebung (pH 1–2 nutzen)?
Ohne Protonentransport würde kein Gradient entstehen bzw. aufrecht erhalten werden und so auch keine Energie konserviert werden?
Nitrifizierung: Welche Teilreaktion katalysieren Nitrosococcus – Arten, welche Teilreaktion Nitrobacter-Arten?
Nitrosococcus: Ammoniumoxidation
Nitrobacter: Nitritoxidation
Was ist das Schlüsselenzym der aeroben Ammoniumoxidation, welche Reaktion katalysiert es, und wo befindet sich das Enzym in der Zelle?
aktivieren Ammonium mit Sauerstoff und meist NADH zu Hydroxylamin (NH2OH)
Integrales Membranprotein in Membranstapel
Was sind die Substrate und was das Produkt der anaeroben Ammoniumoxidation? Warum findet die Reaktion im Anammoxosom der Planctomyceten-Zellen (Brocadia annamoxidans) statt, und wie ist die Anammoxosom-Membran aufgebaut?
Substrat: NH4 + NO2-
Produkt: N2 + 2 H2O
Anammoxosom:
kompartimentiert Hydrazin (N2H4)
Membrankompartimentiert (Bilayer)
Ladderan-Fettsäuren
Fibrillär
Verdeutlichen Sie das Prinzip des reversen Elektronentransport in chemolithotrophen Mikroorganismen durch eine Skizze. Warum ist er wichtig?
für Biomasse-Aufbau
Eisenoxidation bei saurem pH – Beschreiben Sie, wie Acidithiobacillus hilfreich bei der Gewinnung von reinem Cu0 aus Erz (CuS + Fe2S) ist.
1. CuS (schwer löslich) wird zu CuSO42– (leicht löslich) oxidiert
(S-Oxidation d. Acidithiobacillus thiooxidans etc.)
2. Fe3+ wirkt stark oxidierend (Fe-Oxidation d. Acidithiobacillus ferrooxidans etc.)
3. Cu2+ wird mit Fe(0)-Schrott zu Cu reduziert, fällt aus
4. Fe2+ wird oxidiert
Last changeda year ago