Was sind abgeleitete (sekundäre) biologische Datenbanken?
Abgeleitete (sekundäre) biologische Datenbanken filtern und interpretieren die Informationen der primären Datenbanken nach bestimmten Kriterien.
Manuell kontrolliert
Datenbank für Proteinfamilien und Domänen und
funktionellen Gruppen.
Biologisch signifikante Muster sollen erkannt werden, die
für die Funktion einer Proteinfamilie wichtig sind.
Sequenzen können im Fasta-Format eingegeben werden.
Was ist die Datenbank Pfam?
Protein families database
Klassifikation von Proteinen aufgrund von Sequenzähnlichkeiten
der Proteine.
Was ist die CATH Datenbank?
CATH (Class, Architekture, Topology, Homology) funktioniert
ähnlich wie SCOP. Mithilfe der FASTA-Sequenze eines Proteins,
können Sie Struktur und Funktion eines Proteins ermitteln.
Was ist die STRING Database?
Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins
Gibt direkte (physikalische) und indirekte (funktionelle)
Zusammenhänge und Interaktionen zwischen Proteinen wieder.
Experimentelle Daten, andere Datenbanken und berechnete
Interaktions-vorhersagen.
Was ist PDBsum?
PDBSum bereitet die Analysen von Proteinstrukturen graphisch auf.
Liganden-Bindungsstellen und Protein-Protein-Interaktionen können extrahiert werden.
Manuell kontrolliert.
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