Wie stellt die Zelle ATP her?
durch Substratkettenphosporylierung
durch Elektronentransport-gekoppelte Phosphorylierung
aus ADP und anorganischem Phosphat
Was passiert bei der Substratkettenphosphorylierung?
Direkte Übertragung einer Phosphatgruppe von einer energiereichen phosphorylierten Verbindung (entsteht als Intermediat eines Stoffwechselweges, z.B. der Glykolyse) auf ADP
Wo & wie findet die Elektronentransport-gekoppelte Phosphorylierung statt?
In der Atmungskette
—>Elektronenreansport über Membran-assoziierte Elektronen-Carrier generiert elektrochemisches Protonen-Potential (PMF) an der Membran, das zur ATP-Synthese durch F1F0-ATPase genutzt wird
Was sind chemoorganotrophe Bakterien?
Energiegewinnung erfolgt durch Oxidative Phosphorylierung durch Oxidation einer chemischen organischen Substanz
—>Sie oxidieren organische Verbindungen (Glucose) zur Energiegewinnung
Was sind chemolitotrophe Bakterien?
Energiegewinnung erfolgt durch Oxidative Phosphorylierung durch Oxidation einer chemischen anorganischen Substanz
—>Sie nutzen reduzierte anorganische Verbindungen (NH3, H2S, Fe2+) als Elektronendonoren für ihre Atmungskette (Energiegewinnung)
Welche Rolle hat Sauerstoff bei der aeroben Atmung?
02 dient als terminaler Elektronenakzeptor in der Atmungskette, da sein hohes Redoxpotential maximale Energieausbeutung ermöglicht
Was ist der Unterschied zwischen Nitratatmung und Denitrifikation?
Oxidierte (an)organische Verbindungen
Nitratatmung: NO3- als Elektronenakzeptor, der zu Nitrit reduziert wird
Denitrifikation: NO3- als Elektronenakzeptor wird vollständig zu molekularem Stickstoff reduziert
geringere Energieausbeute aufgrund niedrigerer Redoxpotentiale (vgl. mit O2)
Welche Substrate dienen bei Gärungsreaktionen als terminale Elektronenakzeptoren wenn externe Elektronenakzeptoren nicht zur Verfügung stehen?
Intermediate der katabolen Stoffwechselwege (z.B. Glycolyse) dienen als Elektronenakzeptoren zur Regeneration von NAD+ aus NADH
Welche Substrate werden bei der alkoholischen Gärung umgesetzt?
Pyruvat wird zu Acetaldehyd decarboxyliert, das dann durch die Alkoholdehydrogenase zu Ethanol reduziert wird
Welche Substrate werden bei der homofermentativen Milchsäuregärung umgesetzt?
Pyruvat wird durch die Lactat-Dehydrogenase direkt zu Milchsäure reduziert
Was sind phototrophe Bakterien?
Sie wandeln Lichtenergie durch Photosynthese in chemische Energie um
Wie unterscheidet sich die anoxygene Photosynthese von der oxygenen?
Anoxygen: Elektronen stammen aus Oxidation externer Elektronendonoren
—> Synthese von ATP durch Elektronentransport-gekoppelte Phosphorylierung (angetrieben durch zyklischen Elektronentransport über PS II)
Oxygen: Elektronen stammen aus der Spaltung von Wasser und fließen dann vom PS II zum PS I und werden von diesem auf NADP+ übertragen
Wie definiert man heterotrophe Organismen?
Organismen, die organische Verbindungen als C-Quelle verwenden
(Werden organische Verbindungen auch als Energiequelle genutzt, wird der Organismus als chemoorganoheterotroph bezeichnet)
Autotrophe Organismen
…können CO2 als einzige C-Quelle nutzen
Welche Intermediate der Glykolyse können zur Substratphosphorylierung genutzt werden?
1,3-Bisphosphoglycerat
Phosphoenolpyruvat
Was sind Exoenzyme?
Hydrolytische Enzyme, die Makromoleküle wie Proteine, Polysaccharide und Lipide in kleinere Bestandteile zerlegen zum Zweck der Energie und C Gewinnung
Die Enzyme werden schließlich vom Organismus nach außen abgegeben (sekretiert)
Was ist der Unterschied zwischen der Oxidativen & der Photophosphorylierung?
Oxidative Phosphorylierung: Elektronen der Atmungskette stammen aus Oxidation einer chemischen Verbindung
—>Chemotrophie (Energiequelle=chemische Substanz)
Photophosphorylierung: Elektronen stammen aus Licht-induzierten Oxidation von (Bacterio-)Chlorophyll
—>Phototrophie (Energiequelle=Licht)
Nenne die zentralen katabolen Stoffwechselwege in Bakterien!
Abbau von Glucose zu Pyruvat
—>Glykolyse
—>KDPG-Weg
—>oxidativer Pentosephosphat-Zyklus
Oxidative Decarboxylierung von Pyruvat
—>Pyruvat + CoA —> Acetyl-CoA + CO2
Citrat Zyklus
—>Oxidation der Acetylgruppe von Acetyl-CoA zu CO2
Bilanz: Glucose —> 10 NADPH + 2 FADH2 + 4 ATP + 6 CO2
Wie betreibt ein chemoorganotropher Organismus Atmung?
Oxidation eines organischen Substrates (z.B. Glucose) via katabole Stoffwechselwege & Bildung von NADH
Atmungskette
—>Regeneration von NAD+
—>Redox-Kaskade zwischen Membran-assoziierten Elektronen-Carriern & Reduktion des terminalen Elektronenakzeptors
—>Aufbau der PMF durch, bei den Reaktionen freiwerdende Energie
Elektronentransport-gekoppelte Phosphorylierung
—> ATP-Synthese durch R1F0-ATPase
Wichtige Komplexe in der Atmungskette
NADH-Dehydrogenase = NADH-Ubichinon-Oxidoreduktase
Succinat-Dehydrogenase = Succinat-Ubichinon-Oxidoreduktase
Cytochrom bc1-Komplex = Ubichinol-Cytochrom c-Oxidoreduktase
Cytochrom-Oxidase aa3 = Cytochrom c-Oxidase
Nenne Mechanismen zum Aufbau der Protonenmotorischen Kraft
Redoxenzymkomplex als Elektronentransport-getriebene Protonenpumpe
—>NADH-Dehydrogenase,…
Q-Loop/Zyklus
—>Reduktion von Ubichinon gekoppelt an Aufnahme von H+ aus Cytoplasma & anschließende Rück-Oxidation von Ubichinol setzt H+ auf Außenseite frei
Oxidation des des Donorsubstrates an der Außenseite der Membran steht H+ frei, Reduktion des Akzeptorsubstrates im Cytoplasma verbraucht H+
Inwiefern wird die Atmungskette von E.coli durch den O2 Partialdruck der Umgebung beeinflusst?
In Abhängigkeit von der O2 Verfügbarkeit werden unterschiedliche Terminale Oxidasen exprimiert
—>viel O2: Ubichinol-Oxidase bo3 ( wirkt als Protonenpumpe)
—>wenig O2: Ubichinol-Oxidase bd (wirkt nicht als Protonenpumpe)
Mögliche Atmungstypen bei E.coli
Aerobe Atmung: O2 als terminaler Elektronenakzeptor (durch Ubichinol-Oxidase)
—>vollständige Oxidation von Glucose zu CO2 (energiereich)
Nitratatmung: NO3- als terminaler Elektronenakzeptor (durch Nitrat-Reduktase)
—>unvollständige Oxidation von Glucose zu Acetat (energieärmer)
Nenne geeignete Elektronenakzeptoren für die anaerobe Atmung
Oxidierte organische Verbindungen
—>Fumarat
Oxidierte Anorganische Verbindungen
—>Nitrat, Sulfat, Eisen 3+, CO2
Warum muss die Gärbilanz immer ausgeglichen sein?
Durch Gärungsreaktionen muss genauso viel NADH verbraucht werden, wie beim oxidativen Abbau des organischen Substrats entsteht
—>Aufrechterhaltung der ATP-Produktion über Substratkettenphosphorylierung
Wie wird NAD+ regeneriert?
Vgl Aerobe & Anaerobe Atmung & Gärung
Aerobe & Anaerobe Atmung: durch Atmungskette
Gärung: durch Reduktion eines Stoffwechselintermediats
Wie unterscheiden sich Membran-gebundene Hydrogenasen von cytoplasmatischen Hydrogenasen?
Membran-gebundene: Speisen Elektronen in die Atmungskette (zur Energiegewinnung)
Cytoplasmatische: Erzeugung von Reduktionskraft für die Reduktion von NADP+ zu NADPH
Wie fließen die Elektronen bei der anoxygenen Photosynthese (Purpurbakterien)?
Zyklischer Elektronenfluss:
—>Nach durchlaufen der Elektronentransportkette füllen die Elektronen wieder die Lücke am Bacteriochlorophyll auf
Reduktion von NADPH aus NADP+ durch reversen Elektronenfluss (Elektronen stammen aus der Oxidation externer Elektronendonoren)
—>zu Lasten der PMF
Warum ist bei anoxygenen phototrophen Bakterien kein reverser Elektronenfluss nötig zur NADPH-Synthese nötig?
Weil die Elektronen nach durchlaufen der Elektronentransportkette über Ferredoxin direkt auf NADP+ übertragen werden
Wofür kann die protonenmotorische Kraft genutzt werden?
ATP-Synthese
Reverser Elektronenfluss
Stofftransport
Flagellenrotation
Was können prototrophe Organismen?
Prototrophe Organismen können alle Zellsubstanzbestandteile (Aminosäuren, Nucleotide, Makromoleküle, Cofaktoren, usw) aus den zentralen Stoffwechselintermediaten & anorganischen Salzen synthetisieren
—>benötigen NUR 1 Verbindung als Kohlenstoffquelle um zu wachsen
Was sind auxotrophe Organismen?
Auxotrophe Organismen sind zum wachsen auf organische Zusatzstoffe (Suppline) angewiesen
Was sind anaplerotische Reaktionen?
Auffüllreaktionen zur Regeneration, der für Biosynthesen aus dem Citrat Zyklus abgezweigten Intermediate
—>z.B. Glyoxylat-Zyklus
Welche Aminosäure Familien gibt es und aus welchen Stoffwechselintermediaten werden sie synthetisiert?
Serinfamilie
—>3-Phosphoglycerat (aus Glykolyse)
Aromatenfamilie
—>PEP (abhängig) (aus Glykolyse)
Alaninfamilie
—>Pyruvat (aus Glykolyse)
Aspartatfamilie
—>Oxalacetat (aus Citrat-Zyklus)
Glutamatfamilie
—>alpha-Ketoglutarat (aus Citrat-Zyklus)
Aus welchem Stoffwechselintermediat werden Hexosen (später Polysaccharide) synthetisiert?
Aus Glucose-6-Phosphat (aus der Glykolyse)
Aus welchem Stoffwechselintermediat werden Pentosen (später Nukleinsäuren/Nucleotide) synthetisiert?
aus Glucose-6-Phosphat (aus Glykolyse)
Aus welchem Stoffwechselirmediat werden Fettsäuren (später Lipide) synthetisiert?
Aus Acetyl Co-A (Glykolyse)
Welche Aminosäuren gehören in die Serinfamilie?
Serin
Glycin
Cystein
Welche Aminosäuren gehören in die Aromatenfamilie?
Tryptophan
Tyrosin
Phenylalanin
Welche Aminosäuren gehören in die Alaninfamilie?
Alanin
Valin
Leucin
Welche Aminosäuren gehören in die Aspartatfamilie?
Aspartat
Asparagin
Alle andern (Methionin, Isoleucin, Lysin, Threonin)
Welche Aminosäuren gehören in die Glutamatfamilie?
Glutamat
Glutamin
Prolin
Was passiert in der Gluconeogenese?
Pyruvat —> Glucose
Ist die Umkehrreaktion zur Glykolyse (bis auf 3 irreversible Schritte der Glykolyse)
Wozu dient der Glyoxylat-Zyklus?
Zur Synthese von C4-Körpern aus C2-Einheiten
Seitenweg vom Citrat-Zyklus
Anaplerotisch
Isocitrat wird durch die Isocitrat-Lyase in Glyoxylat & Succinat gespalten
Acetyl-CoA & Glyoxylat wird durch die Malat-Synthase zu Malat
Von Oxalacetat wird mithilfe der Phosphoenolpyruvat-Carboxykinase CO2 abgespalten & Phosphoenolpyruvat entsteht
Welche Elemente gehören zu den Makromolekülen und in welcher Form kommen diese in der Zelle vor?
Sauerstoff —> fast alle org. Verbindungen
Wasserstoff —> alle org. Verbindungen
Kohlenstoff —> alle org. Verbindungen
Stickstoff —> Aminosäuren, Purine, Pyrimidine
Phosphor —> DNA, RNA, Phospholipide…
Schwefel —> Aminosäuren, Vitamine, FeS-Zentren
Wie können Nährstoffe (größere, polare Moleküle) in die Bakterienzelle aufgenommen werden?
Durch Integrale Membranproteine (Kanalproteine & Transporter)
Wie erfolgt der Stofftransport über die äußere Membran gramnegativer Bakterien?
Über Porine
—>wassergefüllte Kanäle
—>Homotrimere, beta-Barrel-Proteine
—>passiver Transport durch Diffusion
Wie erfolgt der Stofftransport durch die Cytoplasmamembran?
erleichterte Diffusion
—>Diffusion durch ein Kanalprotein (passiver Transport)
Sekundärer Transport
—>energetisiert durch elektrochemischen Gradienten eines cotransportierten Stoffes (aktiv)
—>Symport
—>Antiport
—>Uniport (z.B. Aufnahme von positiv geladenen Substratmolekülen unter Ausnutzung des Membranpotentials (innen negativ))
Primärer Transport
—>gekoppelt an exotherme chemische (oder photochemische) Reaktion (aktiv)
—>Primäre Transporter: Protonenpumpen, ATPasen & ABC-Transporter
—>Aufbau des elektrochemischen Stoffgradientens, den sekundäre Transporter nutzen
Gruppentranslokation
—>PEP abhängiges Phosphotransferase-System zur Aufnahme von Zuckern & Zuckeralkoholen
—>Modifikation (Phosphorylierung) des Substrats beim Transport (Enzym 2b)
Wozu dienen Exoenzyme?
Dem Abbau von Biopolymeren
—>Zerlegung von Makromolekülen durch Hydrolyse von glycosidischen, Peptid- oder Esterbindungen in monomere Bausteine oder oligomere Bruchstücke, die dann vom Bakterium aufgenommen werden können
—>werden danach von den Bakterien sekretiert oder sind an Membranaußenseite gebunden
Wie wird die Expression von Exoenzymen reguliert?
substratreguliert, d.h. die Expression findet nur bei Vorhandensein des polymeren Substrats statt
Nenne Beispiele für Exoenzyme
Cellulase, Amylase, Chitinase, Pullulanase
Proteinasen
(Phospho)lipasen
Phosphodiesterasen
Was ist der Unterschied zwischen autotrophen & heterotropgen Bakterien?
Autotrophe Bakterien
—>können CO2 als einzige Kohlenstoffquelle zur Synthese aller kohlenstoffhaltiger Zellbestandteile nutzen, keine organische Kohlenstoffquelle nötig
Heterotrophe Bakterien
—>benötigen organische Verbindungen als Kohlenstoffquelle für die Neusynthese von Zellmaterial
—>Zucker, Polysaccharide (Stärke, Cellulose, Chitin), Lipide, Fettsäuren, org. Säuren, Aminosäuren…
Nenne die möglichen Endprodukte der gemischten Säuregärung in Enterobakterien!
Glucose zu …
Lactat (über Pyruvat)
Ethanol (über Acetyl-CoA & Acetaldehyd)
Acetat (über Acetyl-CoA & Acetylphosphat)
CO2 & H2 (über Formiat)
Succinat (über Oxalacetat, Malat & Fumarat)
Was passiert bei der Butandiol-Gärung in Enterobakterien?
Pyruvat —> (mithilfe der Acetolactat-Synthase, -Decarboxylase & Butandiol-Dehydrogenase) 2,3-Butandiol
—>Gärbilanz ist unausgeglichen!
—>in einer 2. Gärreaktion wird deswegen Ethanol gebildet
Was weißt der Voges-Proskauer-Test nach?
Die Butandiol-Gärung (Endprodukte: Butandiol, Ethanol)
Was weist der Methylrot-Test nach?
Dass eine gemischte Säuregärung stattgefunden hat (Endprodukte: Lactat, Acetat, Succinat)
Nenne verschiedene Wege zur CO2 Fixierung!
Calvin-Zyklus
Reduktiver Citrat-Zyklus
Reduktiver Acetyl-CoA-Weg
Was prüft der Indol-Test?
Die Fähigkeit zur Verwertung der Aminosäure Tryptophan über die Tryptophanase
Welche Stickstoffquellen nutzen Bakterien?
Anorganische: NH4+ (Ammonium), NO3-, N2
Organische: Aminosäuren, Purin- & Pyrimidinbasen, Harnstoff
Was passiert bei der Stickstoff-Fixierung & durch welches Enzym wird dies katalysiert?
Der Nitrogenase Enzymkomplex katalysiert die Reduktion von molekularem Stickstoff zu Ammoniak (kann in der Form von anderen Organismen als N-Quelle genutzt werden)
Wie werden Stickstoff-Quellen von Bakterien verwertet vgl. anaerob vs. aerob!
anaerob: NH4+ wird aufgenommen, H+ abgespalten —> NH3 wird auf die N-Überträger Glutamat oder Glutamin übertragen
aerob: NO3- wird aufgenommen, über assimilatorische Nitrat-Reduktase zu NO2-, was wiederum über die assimilatorische Nitrit-Reduktase zu NH3 wird —> ebenfalls auf Glutamat/Glutamin übertragen
Nenne Schwefel-Quellen!
SO42- (Sulfat), S2O3- (Thiosulfate), H2S (Schwefelwasserstoff), organischen S-Verbindungen
Wie wird Schwefel von Bakterien aufgenommen & verwertet?
Aufnahme durch hochaffines ABC-Transportsystem
über die assimilatorische Sulfatreduktion Umwandlung zum Hydrogensulfidanion HS-
Übertragung auf S-Überträger Cystein-SH
Wie werden Phosphor-Quellen von Bakterien aufgenommen und verwertet?
Bei Phosphat-Mangel: Aufnahme durch hochaffines ABC-Transportsystem
Bei Phosphat-Überschuss: Aufnahme durch Symporter
—>Substratkettenphosphorylierung oder Oxidative Phosphorylierung
—>ATP als P-Überträger
Nenne die targets wo Antibiotika in der Zelle wirken kann!
Zellwandsynthese
DNA Gyrase
DNA-Abhängige RNA-Polymerase
Proteinbiosynthese (Hemmstoffe der ribosomalen 50 S-Einheit & 30 S-Einheit)
Folsäurestoffwechsel
RNA-Elongation
Welches Antibiotikum wirkt an der DNA-abhängigen RNA-Polymerase?
Rifampicin
Welches Antibiotikum wirkt an der DNA Gyrase?
Chinolone
Welche Antibiotika wirken an der Zellwand Synthese?
Penicillin
Cephalosporine
Glycopeptide…
Welche Antibiotika wirken am Folsäurestoffwechsel?
Sulphonamide & Trimethoprim
Welche Antibiotika wirken an der Proteinbiosynthese (30 S & 50 S-Einheit)
30 S-Einheit: Aminoglycoside, Tetracycline
50 S-Einheit: Macrolide, Chloramphenicol, Clindamycin
Wie wirkt Penicillin am Angriffsort?
Penicillin hemmt die die Transpeptidierungsreaktion bei der Zellwandsynthese (Quervernetzung der Peptidoglycanstränge)
Worauf basiert die selektive Toxizität von Antibiotika?
Angriffsorte sind Komponenten der bakteriellen Physiologie, die …
—>in der Physiologie von Eukaryoten nicht vorkommen (Zellwand aus Peptidoglycan)
—>sich in Eukaryoten strukturell unterscheiden (Ribosomen, RNA-Polymerase)
Beschreibe natürliche Antibiotikaresistenzen!
Fehlende Zielstruktur zum Angriff des Antibiotikums
—>Resistenz von Mycoplasmen (zellwandlose Bakterien) gegenüber Penicillin
Impermeable Zellhülle für das Antibiotikum
—>Penicillin G wird von den meisten gram-negativen Bakterien nicht aufgenommen
Beschreibe erworbene Antibiotikaresistenzmechanismen!
chemische Modifizierung des Antibiotikums
—>bei Beta-Lactam-Antibiotika: Spaltung des Beta-Lactam-Rings durch beta-Lactamasen
—>bei Aminoglycosiden: Acetylierung, Phosphorylierung, Adenylierung
—>bei Makroliden: Hydrolyse, Acetylierung. Phosphorylierung
Aktiver Efflux
—>Herauspumpen des Antibiotikums durch (Multidrug)-Efflux-Pumpen
Veränderung der Zielstrukturen des Antibiotikums
—>z.B. durch Einbau modifizierter PBPs bei Zellwandsymthese
Modifizierung des Stoffwechselwegs, in den das Antibiotikum eingreift
—>z.B. durch Produktion alternativer Enzyme
Wie entstehen Antibiotikaresistenzen?
Spontane Entstehung durch Mutation
—>Mutation im gyrA-Gen bewirkt Resistenz gegenüber Chinolonen
Erwerb von Resistenzdeterminaten
—>genetische Information für Proteine, die Antibiotikaresistenz verleihen (z.B. Beta-Lactamasen, Multi Drug-Efflux-Pumpen…)
—>Resistenzdeterminaten häufig Bestandteile mobiler genetischer Elemente
—>horizontaler Gentransfer
Welche verschiedenen Mechanismen gibt es beim horizontalen Gentransfer?
Transformation
—>natürlich kompetente Bakterien haben von sich aus schon Tendenz DNA auszubilden
Transduktion
—>Bakterien haben von sich aus nicht die Tendenz DNA aus Umgebung aufzunehmen
—>Übertragung über Phagen
Konjugation
—>DNA Austausch zwischen 2 Bakterien über Sekretionssysteme
Was sind Bacteriocine?
kleine Hitze-stabile antimikrobielle Peptide, die von Gram-positiven & Gram-negativen Bakterien via ribosomale Proteinsynthese produziert werden
—>Bacteriocine Gram-negativer Bakterien: Microcine
Wie wirken Bacteriocine Gram-positiver Bakterien?
Depolarisierung (positiver) der Cytoplasmamembran
Inhibierung der Zellwandsynthese & Porenbildung
Wie wirken Microcine (Gram-negativer Bakterien)?
Inhibierung von:
Replikation
Transkription
Translation
Was sind Bacteriolysine & was bewirken sie?
Große Hitze-labile antimikrobielle Proteine
—>Lyse (Auflösung) der bakteriellen Zellwand
Was sind Colicine & wie wirken sie?
Proteintoxine von E.coli, die nah verwandte Bakterien abtöten
—>Membranpermeabilisierung
—>Degradation von Nucleinsäuren (DNA & RNA)
—>Inhibition der Zellwandsynthese
Beschreiben Sie kurz den Aufbau der Atmungskette von E.coli. Wie wird dieser durch den Sauerstoff-Partialdruck in der Umgebung beeinflusst?
NADH Dehydrogenase I als Protonenpumpe
—>NADH als Elektronendonor
Chinonpool
-Ubichinol-Oxidase bo3 als terminale Oxidase bei viel Sauerstoff (Protonenpumpe)
-Ubichinol-Oxidase bd als terminale Oxidase bei wenig Sauerstoff (keine Protonenpumpe)
Erläutere stichpunktartig den Aufbau eines Siderophor-Aufnahmesystems von Gram-negativen Bakterien
Siderophor= niedermolekulare Verbindung mit hoher Fe3+ Affinität
Rezeptorprotein in der äußeren Membran schleust Fe3+-Siderophor-Komplex ins Periplasma
Periplasmatisches Bindeprotein leitet Fe3+-Siderophor-Komplex zum spezifischen ABC-Transporter in der Cytoplasmamembran
Transport durch Cytoplasmamembran & Freisetzung der Eisenionen durch …
—>Reduktion von Fe3+ zu Fe2+
—>Spaltung des Siderophors
Welche Wirkungsweisen sind typisch für Colicine?
Membranpermeabilisierung
Degradation von Nucleinsäuren (DNA & RNA)
Inhibition der Zellwandsynthese
Wo wirkt Penicillin in der Bakterienzelle?
Beschreibe kurz die Atmungskette von E.coli!
NADH-Dehydrogenase 1 oxidiert NADH zu NAD+ & pumpt 4H+ aus Cytoplasma raus
Chinonpool überträgt Elektronen auf Ubichinol-Oxidase bo3, die den terminalen Elektronenakzeptor O2 zu H2O reduziert & als Protonenpumpe wirkt
Wodurch wird beim primären Transport die Stoffaufnahme entgegen eines Konzentrationsgradienten energetisiert?
Durch eine exotherme chemische & photochemische Transport
Welche Rolle spielt Glutamat bei der Aminosäure Synthese?
Glutamat als Donor für 80% des Stickstoffs für Alpha-Aminogruppen der Aminosäuren
Was sind die Endprodukte des Pentosephosphat-Zyklus?
Glycerinaldehyd-3-Phosphat
Fructose-6-Phosphat
Welche Rolle spielt der Pentose-Phosphatzyklus für den Anabolismus?
Liefert Ausgangssubstrate für:
Gluconeogenese (Glycerinaldehyd-3-Phosphat, Fructose-6-Phosphat)
Nukleotidsynthese (Ribose-6-Phosphat)
Andere Biosynthesen
Reduktionskraft für die Biosynthesen (NADPH)
Was passiert wenn ein Bakterium durch eine Mutation keine Amylase produzieren kann? Was hat das für Folgen?
Verliert die Fähigkeit Stärke abzubauen
Führt zu Energiemangel & verringertem Wachstum wenn keine andere C-Quelle in Umgebung vorhanden ist
Wie viele terminale Oxidasen haben denitrifizierende Bakterien?
Nitrat-Reduktase
Nitrit-Reduktase
NO-Reduktase
N2O-Reduktase
Welche Rolle spielt der Q-Loop in der Atmungskette? Wofür steht die Abkürzung?
Reduktion von Ubichinon nimmt Protonen aus Cytoplasma auf
Durch Rückoxidation von Ubichinol zu Ubichinon werden die Protonen nach außen abgegeben
—>Aufbau der protonenmotorischen Kraft
Quinone engl. für Ubichinon
Wie viele Kopplungsstellen hat die Atmungskette von E.coli, die Nitratatmung betreiben & wie heißen diese?
—>Kopplungsstellen = Stellen, an den Protonen über Membran translokalisiert werden
NADH-Dehydrogenase I
Warum ist die Energieausbeute bei chemolitotrophen Bakterien nicht so hoch wie bei chemoorganotrophen Bakterien?
Weil mögliche Elektronendonoren (anorganischer Verbindungen) generell relativ hohe (positive) Redoxpotentiale haben als organische Verbindungen
—>geringere Energieausbeute
Was sind mögliche Elektronendonoren für chemolitotrophe Bakterien?
H2, H2S (Schwefelwasserstoff), S, Fe2+, NO2- (Nitrit), NH4+ (Ammonium)
Welche Funktion hat der Cytochrom bc1-Komplex in der photosynthetischen Membran der Purpurbakterien?
Beförderung von Elektronen aus Chinon-Pool in der Membran heraus zu Cytochrom c2-Komplex
Was passiert bei der Nitrosifizierung?
Oxidation von Ammoniumionen zu Nitrit durch Nitrosobakterien
Welche Reaktion wird durch die Nitrogenase gesteuert?
Die Reduktion von molekularen Stickstoff zu Ammoniak
Erläutere den Ablauf der alkoholischen Gärung in S. cerevisae mit Glucose als C-Quelle (wichtige Reaktionsprodukte & -Mechanismen)
Oxidation von Glucose zu 2 Pyruvat in Glycolyse (& 2NAD+ zu 2 NADH reduziert)
2 Pyruvat über Pyruvatdecarboxylase zu 2 Acetaldehyd decarboxyliert
2 Acetaldehyd mit Alkoholdehydrogenase zu 2 Ethanol reduziert (2NADH dabei zu 2NAD+ oxidiert)
—> durch Gärreaktion wird genauso viel (2 NAD+) regeneriert, wie in Glycolyse zu 2 NADH reduziert wird
Was versteht man unter Denitrifikation/ Nitratatmung & zu welcher Form des Energiestoffwechsels zählt diese?
Nitrat wird unter Energiegewinnung zu gasförmigem molekularen Stickstoff reduziert
—>Katabolismus (anaerobe Atmung)
Wo wirken beta-Lactame?
Inhibierung der Zellwandsynthese
Nenne ein Beispiel für ein beta-Lactam!
Handelt es sich bei NADH-Dehydrogenasen um primäre oder sekundäre Transporter?
Primärer Transporter, da gekoppelt an exotherme chemische Reaktion
—>Aufbau der PMF
Wie werden mit Fe3+-Ionen beladene Siderophore in die Cytoplasmamembran von Bakterien aufgenommen?
Von spezifischen ABC-Transportern
Was sind Porine & wozu dienen sie?
Wassergefüllte Kanäle in äußerer Membran Gram-negativer Bakterien
erlaubt Aufnahme von Molekülen mit MG<600 Da durch Diffusion (passiver Transport)
Welche Stoffwechselwege werden in Bakterien genutzt, um Glucose in C3-Verbindungen abzubauen? Benenne die jeweils entstehende C3-Verbindung!
Glycolyse: Pyruvat
KDPG-Weg: Pyruvat & Glycerinaldehyd-3-Phosphat
Pentosephosphatweg: Glycerinaldehyd-3-Phosphat
Erläutere die Aussage, dass unterschiedliche terminale Oxidasen ausgebildet werden können!
Es können unterschiedliche terminale Oxidasen ausgebildet werden
Welche sauren Endprodukte entstehen bei der gemischten Säuregärung?
Lactat (Milchsäure)
Acetat (Anion der Essigsäure)
Succinat (Anion der Bernsteinsäure)
Ameisensäure
Unter welchen Bedingungen betreibt E.coli gemischte Säuregärung?
Unter anaeroben Bedingungen
Bewerte die Energiebilanz der Gärung im Vergleich zur Atmung & begründe!
Bei gemischter Säuregärung deutlich geringere Energieausbeute, da Glucose nicht vollständig zu CO2 oxidiert wird
Nenne 3 Reaktionswege über die Bakterien Kohlendioxid fixieren können! Wie bezeichnet man diese Bakterien?
Calvin-Benson-Zyklus
—>Autotrophe Bakterien
Auf welchem Weg werden Fettsäuren in Bakterien abgebaut? Welches Endprodukt entsteht beim Fettsäureabbau?
Abbau von Fettsäuren durch Beta-Oxidation
Schrittweise Abspaltung von C2-Einheiten = Acetyl-CoA
Nenne den Wirkort der Aminoglycosid-Antibiotika!
Blockieren die 30s-Ribosomunterheit
—>mRNA wird falsch abgelesen, synthetisiertes Protein ist nicht korrekt
Welcher grundsätzliche Unterschied hinsichtlich ihrer Synthese besteht zwischen Peptidantibiotika & Bacteriocinen?
Peptidantibiotika: Kondensation von Aminosäuren (Polymerisation)
Bacteriocine: ribosomale Proteinsynthese
Auf welche Weise stellen Bakterien ihre Versorgung mit Eisen-Ionen sicher? Erkläre kurz den zugrundeliegenden Mechanismus!
Eisenaufnahme mithilfe von Siderophoren
niedermolekulare Verbindungen mit hoher Affinität zu Fe3+
—>Fe3+-Siderophor-Komplexe unter Energieverbrauch über spezielle Transportproteine in äußerer & innerer Membran in Bakterienzelle aufgenommen
Nenne die Gärung, die E.coli am ehesten verwendet?
Gemischte Säuregärung
Warum betreiben Bakterien Gärung?
Zur Energiegewinnung unter anaeroben Bedingungen, wenn kein externer Elektronenakzeptor zur Verfügung steht
—>Redoxreaktionen zwischen Kohlenstoffverbindungen
Warum ist die Synthese von Acetylphosphat zum Vorteil für gärende Bakterien?
Acetylphosphat kann von Acetatkinase zu Acetat umgewandelt werden
—>Energie wird frei, die zur ATP-Synthese genutzt wird
Nenne Unterschiede zwischen der mitochondrialen Atmungskette & der von E.coli!
Mitochondrien: Cytochrom-Oxidase positiv
E.coli: Cytochrom-Oxidase negativ
Mitochondriale Atmungskette hat zusätzlich Komplex III als zusätzlichen Cytochrom-Oxidase-Komplex (Kopplungsstelle)
—>Translokalisation von 10-12 H+
—>E.coli nur 8 H+
Nenne die Enzyme die notwendig sind damit ein Bakterium Stickstoff aus Nitrat verwerten kann!
Dissimilatorische Nitratreduktase
Was für eine Reaktion ist die Nitratfixierung? Wie heißt das relevante Enzym? Was entsteht als Nebenprodukt?
Dient dem Anabolismus, also dem Gewinn von Biomasse (Biosynthese)
—>katalysiert durch die assimilatorische Nitratreduktase (—>Expression unter Stickstoffmangelbedingungen)
—>Nitrat—>Nitrit—>Ammonium (nur so viel wird reduziert, wie für Biosynthesen benötigt)
Was passiert bei der Stickstoff-Fixierung?
Reduktion von atmosphärischem Stickstoff zu Ammoniak über Nitrogenase-Enzym-Komplex
—>Komplex bestehend aus Dinitrogenase & Dinitrogenase-Reduktase
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