Nenne Vor-und Nachteile von periplasmatischer Proteinproduktion.
Vorteile:
wenig Wirtsproteine
geringe Proteolyseaktivität
oxidierendes Milieu -> Disulfidbrücken
N-Terminus (Abspaltung Signalpeptid)
Nachteile:
Transport durch innere Membran -> klappt manchmal nicht
keine Abspaltung des Signalpeptids
periplasmatische Inclusion Bodies
Wie kann man Proteinproduktion im Periplasma verbessern?
niedrigere Wachstumstemp
Chaperone
surA, FkpA, DsbA,C (—> pTUM4!)
unterschiedliche Signalsequenzen
PhoA, OmpA/T, PelB
Koproduktion der Signalpeptidase I (viel hilft viel)
Koproduktion von Sec-Transportsystem (viel hilft viel)
Skizzieren Sie den groben Ablauf des Transports von Peptiden duch die cytoplasmische Membran.
SecA,B -> erkennen Signalprotein
Pore: SecY,G,E -> ATP -> ins Periplasma
Schildern Sie kurz die Proteinfaltung im Cytoplasma. Nennen Sie die Faltungshelfer (Chaperone).
folding chaperone
GrpE, GroEL/S
holding chaperone
IbpA/B
Hsp31,33
disaggregating chaperone
ClpB
Geben Sie eine Übersicht von vor- und Nachteilen für Peri-, Cytoplasmatische und extrazelluläre Proteinsynthese.
Nennen Sie die vier Klasser der periplasmatischen Faltungshelfer.
Allgemeine chaperone
FkpA
Spezielle chaperone
SurA -> nur outer membrane proteins
PPIases
SurA -> outer membrance beta-barrel proteins
DSB helper chaperone
dsbA-, …
Skizzieren Sie die Proteinfaltung im Periplasma.
Sekretion:
b. Ribosom -> SecB -> SecA,Y Pore -> raus da
c. schon gefaltet raus -> TatABC (nur kleinere Proteine mit twin arginin signal)
Schicksale im Periplasma:
Aggregation
Abbau
Chaperone -> korrekte Struktur
DSB-Ausbildung mit dsbA
dsbA sehr unselektiv, können inkorrekte Brücken werden
dsbC -> korrektur von falschen DSB
Was sind die groben Schritte in der Proteinproduktion nach der Herstellung des Proteins?
Zellaufschluss & Isolierung der Inclusion Bodies
Lösung aus Inclusion Bodies und Entfaltung (Harnstoff)
Rückfaltung (Dialyse/Rückfaltungspuffer)
Was sind Endotixine?
LPS
hydrophil (Polysaccharid)
lipophil (LipidA)
Aufschluss von E.Coli -> Zellwand geht kaputt -> LPS frei
Sehr stabil
ph-stabil
hitze
klebt an Proteinen
—> führt zu starker Immunreaktion im Menschen
bindet an TLR4 (Toll-like-receptor) —> Cytokin ausschütten
Wie kann man Endotoxine erkennen?
sieht man nicht einfach
Blut von Pfeilschwanzkrebsen
Limulus Amebocyten Lysat (LAL) test
wird gelb wenn LPS drin ist
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