L’ouverture et la fermeture de la chromatine dépend …
de la méthylation de l’ADN et des modifications des histones par des mécanismes épigénétiques.
La décision du devenir dépend de son environnement dont le contrôle majeur est assuré par des facteurs de transcription qui ? ils font quoi ?
Sox2 , Oct4 et Nanog ils bloquent en particuliers la voie de différenciation .
Quand sont présentent les cellules souches ?
Au moment de l’embryogenèse mais aussi dans les tissus adultes .
Reprogrammation cellulaire :
Si le mécanisme de différenciation est un mécanisme rarement réversible, il est possible aujourd’hui de reprogrammer les cellules vers un phénotype différent : voire obtenir une cellule souche à partir d’une cellule différenciée.
Etape clé pour l’activation de la transcription :
Reconnaissance + assemblages du complxe d’initiation de la transcription.
Lorsque des molécules d’ARN polymérases se suivent ainsi, chacune se déplaçant à ? et combien de transcrit ?
environ 50 nt par seconde le long de la région codante, plus d’un millier de transcrits peuvent être synthétisés en une heure à partir d’un seul gène
Différents types de régions régulatrice :
Comment ( sous quelle forme) les protéines de régulation vont interagir avec l’ADN ?
Les facteurs tran peuvent interagir seuls ou en dimère ( homo, hétéro - dimères)
facteurs de transcription ont une interaction avec l’ADN qui est …
spécifique + forte
Les régulateurs transcriptionnels formant les complexes multiprotéiques peuvent être :
● Des facteurs de transcription : domaines d’interactions avec l’ADN
● Des co-régulateurs : n'interagissent pas directement avec l’ADN
petite conclusion sur les facteurs généraux :
En conclusion, les facteurs généraux de transcription sont les mêmes pour tous les gènes transcrits par l’ARN polymérase II mais les régulateurs transcriptionnels et les positions de leurs sites de fixation par rapport au promoteur vont différer pour chaque gène.
Dans quel contexte se fait la régulation de la transcription ?
Contexte chromatinien
Récepteurs aux cytokines et voie STAT ( explication du mécanisme):
Il y a dans le cytoplasme des facteurs de transcription de la famille STAT comprenant plusieurs membres qui sont monomériques et inactifs. L’activation des tyrosines kinases des protéines JAK conduit à la phosphorylation des facteurs transcriptionnels STAT qui se dimérisent, puis ils sont transloqués dans le noyau où il vont pouvoir se lier aux promoteurs de gènes cibles.
En conclusion, une forme inactive et cytoplasmique du facteur transcriptionnel STAT va subir une modification post-traductionnelle de type phosphorylation. Ensuite, le dimère STAT change de compartiment pour devenir nucléaire et se lier aux promoteurs.
Exemple du récepteur nucléaire - au glucocorticoide :
hémisite consensus :
AGGTCA
De quoi dépend la specificité de réponses pour les différents ligands ?
● L’orientation des deux hémi-sites avec laquelle les séquences
○ Sont dans le même sens
○ Sont dans un sens opposé
○ Possèdent une orientation inverse
● L’espace entre deux hémi-sites : variant de 0 à 7 nucléotides
○ Permet d’obtenir un grand nombre de combinaisons qui expliquent la diversité et la spécificité des domaines composés à partir des mêmes séquence
L’activation des récepteurs nucléaire fonctionne toujours comme ceux au glucocorticoide ?
NON , il ne fonctionne pas toujours selon ce modèle . Certains récepteurs sont toujours localisés dans le noyau mm ss forme inactive.
Exemple de récepteurs qui ne fonctionne pas selon celui des glucocorticoide :
Explique moi le problème avec le complexe répresseur ( hormone thyroid)
En fait, le complexe répresseur contient des histones désacétylases qui favorisent localement la compaction de l’ADN. Cela empêche l’interaction avec le complexe d’initiation de la transcription ce qui a un effet inhibiteur.
L’arrivée de l’hormone thyroïdienne T3 va provoquer :
● Le remplacement du complexe inhibiteur par un complexe activateur qui contient des histones acétylases
● En acétylant les histones, le complexe activateur favorise .
○ la décompaction des nucléosomes
○ le relâchement de l’ADN → permet la transcription du gène.
Le facteur trans HIF est composé de 2 sous-unités alpha et bêta. Il suit des mécanismes différents selon des cas. En cas de…(tableau)
Comment s’appelle les cellules souches indifférenciées des planires ?
néoblastes
2 propr des cellules souches :
La propriété d’auto-renouvellement recouvre 2 notions : ( 1/2)
La propriété d’auto-renouvellement recouvre 2 notions : (2/2)
Quel mécanisme permet aux cellules souches de se diviser un nombre de fois quasi illimité en contournant ce processus de sénescence réplicative ?
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