Quels sont les types de conséquence fonctionelles des variants ?
Perte de fonction : Le variant empêche la protéine de remplir son rôle normal dans la cellule. Cela peut se produire si la mutation empêche la production de la protéine, la rend instable, ou inactive ses fonctions.
Gain de fonction : Le variant confère à la protéine de nouvelles propriétés ou active ses fonctions de manière anormale. Cela peut entraîner un effet délétère sur la physiologie de la cellule et causer des maladies.
Maladies à transmission autosomique récessive c’est quoi ?
Dans les maladies autosomiques récessives, un individu doit hériter de deux copies mutées du gène (une de chaque parent) pour présenter la maladie.
La perte de fonction est le mécanisme principal ici : la présence d'une seule copie normale (fonctionnelle) du gène suffit pour compenser la mutation et éviter la maladie.
Exemples : Ce mode de transmission est commun dans les maladies liées aux enzymes, appelées enzymopathies, comme la phénylcétonurie, le déficit en 21-hydroxylase et la maladie de Gaucher.
Maladies à transmission autosomique dominante c’est quoi ?
Dans les maladies autosomiques dominantes, un individu n'a besoin que d'une seule copie mutée du gène pour manifester la maladie, car la copie normale ne compense pas les effets du variant.
Les mécanismes responsables de ce mode de transmission incluent :
Déséquilibre quantitatif : Une copie mutée entraîne une surproduction ou une sous-production de la protéine, déséquilibrant la quantité nécessaire au fonctionnement cellulaire normal.
Mutation conférant des propriétés nouvelles à la protéine : Dans certains cas, la mutation modifie la protéine pour qu'elle acquière une fonction toxique ou anormale.
Haploinsuffisance c’est quoi ?
La haploinsuffisance survient lorsque la quantité produite par une seule copie du gène n'est pas suffisante pour maintenir la fonction normale.
C'est un mécanisme commun dans les enzymopathies et dans certaines maladies autosomiques dominantes, où le défaut dans une seule copie du gène suffit à causer la maladie.
Variant auto-actif c’est quoi ?
Un variant auto-actif est un variant qui entraîne l’activation permanente d'un élément sensible, comme un récepteur cellulaire.
Exemple : Dans l’achondroplasie, un variant du gène du récepteur FGFR3 rend le récepteur constituant activement sensible au FGF. Cela signifie que le récepteur est actif en permanence, même sans la présence de son ligand (le facteur de croissance FGF), ce qui conduit à des signaux cellulaires continus et une croissance osseuse anormale.
Variant à effet toxique ?
Ce type de mutation se manifeste lorsqu’une expansion anormale d’acides aminés se produit dans une protéine, ce qui modifie ses propriétés et la rend résistante à la protéolyse (dégradation).
Exemple : Dans la maladie de Huntington, une expansion excessive de glutamines (CAG) dans la protéine huntingtine provoque une accumulation d’agrégats toxiques dans les cellules nerveuses. Ces agrégats deviennent des inclusions nucléaires et entraînent la mort des neurones, menant à des symptômes neurodégénératifs.
Variant dominant négatif c’est quoi ?
Un variant dominant négatif entraîne une désorganisation de la fonction d’une protéine en interférant avec le produit du gène normal ou en perturbant ses interactions avec des partenaires.
Exemple : Dans certaines maladies du collagène (comme l’ostéogenèse imparfaite), une mutation faux-sens du gène COL1A1 altère la formation de la structure en triple hélice de collagène. Cette mutation modifie la structure du réseau de fibres de collagène, ce qui affaiblit la résistance mécanique des os et d’autres tissus.
Ici, le même gène peut être responsable de maladies récessives ou dominantes, en fonction du type de mutation et de son effet.
Marqueur génétique
Segment d’ADN à position connue, utilisé pour suivre l’héritage de segments chromosomiques au fil des générations, souvent analysé pour son polymorphisme.
La capacité d’un marqueur à fournir des informations utiles est mesurée par son taux d’hétérozygotie (la fréquence à laquelle un individu possède deux allèles différents pour ce marqueur).
Locus
Emplacement spécifique d’un gène ou d’une séquence d'ADN sur un chromosome.
Polymorphisme :
Variation génétique neutre dans une population, sans conséquence pathogène
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